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Profile of MicroRNAs Differentially Produced in Hearts from Patients with Hypertrophic Cardiomyopathy and Sarcomeric Mutations

  • Reguero, J.R. (Julián)
  • Martín, María
  • Díaz, Beatriz
  • Morís, César
  • Álvarez, Victoria
  • Coto, Eliecer
Profile of MicroRNAs Differentially Produced in Hearts from Patients with Hypertrophic Cardiomyopathy and Sarcomeric Mutations, MPF was the recipient of a predoctoral fellowship from FICYT-Principado de Asturias. This work was supported by grants from the Spanish Fondo de Investigaciones Sanitarias-Fondos FEDER European Union (FIS-09/0172) and RED de Investigación Renal-REDINREN.
Proyecto:


Genomic profiling of sinonasal squamous cell carcinoma.

  • López, Fernando
  • Llorente, J.L. (José)
  • García-Inclán, Cristina
  • Alonso, Marta
  • Cuesta-Albalad, M.P. (María)
  • Florentino, Manuel
  • Álvarez-Marcos, César
  • Suárez, Carlos
  • Hermsen, M.A. (Mario)
Background. Sinonasal squamous cell carcinomas (SNSCC) are rare tumors with no etiological link to tobacco and alcohol, as opposed to other squamous cell carcinomas of the head and neck (HNSCC). Little is known about the genetic changes in SNSCC. Methods. DNA copy number changes of SNSCC were analyzed by MLPA (multiplex ligation-dependent probe amplification) and microarray comparative genomic hybridization (maCGH), and results were related to clinico-pathological features. Results. Copy number losses most frequently included genes at 9p21, 13q14, 17p13, 17q21 and 18q11. Frequent gains were observed on 8q24, 11q13, 17q12, 19p13 and 20q11-q13. Conclusion. The genomic profile of SNSCC showed a number of chromosomal regions with copy number changes similar to those known in HNSCC, in spite of the differences in etiology., This study was supported by grants IB05-115 of Fundación para el Fomento en Asturias de la Investigación Científica Aplicada y la Tecnología (FICYT), PI05-1387 and EMER07-048 of Fondos de Investigación Sanitaria (FIS), and RD06/0020/0034 of Red Temática de Investigación Cooperativa en Cáncer (RTICC), Spain. The authors thank Eva Allonca and Sira Potes for their technical support, and Bauke Ylstra of the Microarray Facility of the VUmc Medical Center, Amsterdam
Proyecto:


Gene amplification and protein overexpression of EGFR and ERBB2 in sinonasal squamous cell carcinoma

  • Llorente, J.L. (José)
  • Martín, Carlos
  • Vivanco, Blanca
  • Álvarez, César
  • García-Inclán, Cristina
  • Scola, Bartolomé
  • Hermsen, M.A. (Mario)
Background: Sinonasal squamous cell carcinomas (SNSCC) are rare tumors with no etiological link to tobacco and alcohol, as opposed to other squamous cell carcinomas of the head and neck. Despite improvements in the field of surgery and radiotherapy, patients with these tumors still face a very unfavorable prognosis, partly due to its localization in a complex anatomical area, which is of special relevance for surgery and postoperative treatment. Therefore, there is a need for new therapeutic possibilities for this tumor type. Methods: Gene copy numbers of epidermal growth factor receptor (EGFR) and erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2 (ERBB2) were analyzed by FISH and MLPA and protein expression was evaluated by immunohistochemistry in 54 specimens SNSCC and the results were correlated with clinico-pathological and follow-up data. Results: EGFR gene copy number increase were observed in 20/45 (44%) cases, and 21/54 (39%) tumors showed EGFR protein overexpression. Eight of 38 tumors (21%) showed ERBB2 copy number increase, and 4/54 (7%) exhibited elevated protein expression levels. Both copy number increase and protein overexpression of EGFR and ERBB2 were mutually exclusive. KRAS mutations were absent in 37 cases analyzed. Conclusion: A substancial proportion of SNSCC carry alterations in EGFR or ERBB2. Together with the absence of KRAS mutations, these findings indicate that therapies targeting these molecules could be a promising addition to the therapeutical options for these tumors., This work was supported by grants PI05-1387, PI08-1599 and EMER07-048 of Fondos de Investigación Sanitaria (FIS) and RD06/0020/0034 of Red Temática de Investigación Cooperativa en Cáncer (RTICC), Spain.
Proyecto:


Genetic model of transformation and neoplastic progression in laryngeal epithelium

  • Alonso, Marta
  • Rodríguez, Nuria
  • Sampedro, Teresa
  • Domínguez, Francisco
  • Hermsen, M.A. (Mario)
  • Llorente, J.L. (José)
Background: To analyse genetic alterations in the transformation-progression model of larynx tumors. Methods: Copy number changes of 37 genes were analyzed by MLPA in 94 tissue samples. Results: In the smoker normal mucosa group TP53 loss was predominant, while in the precursor lesions CDKN2A loss and CDKN2D gain were most frequent. Precursor lesions with progression presented CTNNB1 loss. In the carcinoma group the most common changes were CDKN2A, MLH1, CTNNB1, CASP6 losses and RECQL4, CCND1, EMS1 gains. Positive lymph node primary tumors were related to TP53, IL1A, RB1 losses and STK11 gain. The lymph node metastases differed from their corresponding primary tumor in LMNA, RECQL4 and IGF1R losses, and N33, CDKN2D gains. Conclusions: Genetic changes and new key genes were found associated to specific steps of transformation-progression. We included new steps, not presented in the classical models: normal mucosa tobacco exposed, positive lymph node primary tumor and corresponding lymph node mestatases., projects PI02-0831 and PI07-0153 from “Fondos de Investigaciones Sanitarias” (FIS), Instituto Salud Carlos III, Spain. Project IB05-115 from Fundación de Investigación Científica y Tecnológica (FICYT), Asturias. Red Temática de Investigación Cooperativa en Cáncer (RTICC) (RD06/0020/0034) del ISCIII, Spain. IUOPA-Obra Social Caja Astur, Spain.
Proyecto:


Genetic profile of second primary tumors and recurrences in head and neck squamous cell carcinomas

  • Álvarez, César
  • Llorente, J.L. (José)
  • Alonso, Marta
  • Domínguez, Francisco
  • Argüelles, Luis
  • Hermsen, M.A. (Mario)
Background: Second primary tumors and recurrences are an important problem in patients with head and neck squamous cell carcinoma. To determine the genetic changes in tumor samples in order to improve knowledge of tumor progression. Methods: Copy number changes of 37 genes were analyzed by multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) in 36 primary tumors and their corresponding 21 second primary tumors and 15 recurrences. Results: CCND1 and EMS1 amplifications and gain of BCL2L1 were the most common genetic alterations in the primary tumor, second primary tumor and recurrence samples. Gains of ERBB2 and PTPN1 were associated to recurrences. Conclusions: Specific genetic profiles for each group have been found. Similarities between primary tumor and second primary tumor and dissimilarity between primary tumor and recurrence suggest that clinic-pathological criteria do not always accurately differentiate these entities. Genetic profiling may aid in the diagnosis and prognosis of these difficult cases, Projects PI02-0831 and PI07-0153 from “Fondos de Investigaciones Sanitarias” (FIS), Instituto Salud Carlos III, Spain. Project IB05-115 from "Fundación de Investigación Científica y Tecnológica" (FICYT), Asturias. Red Temática de Investigación Cooperativa en Cáncer (RTICC) (RD06/0020/0034) del ISCIII, Spain. IUOPA-Obra Social Caja Astur, Spain.
Proyecto:


Actividad de los principales enzimas antioxidantes durante el periodo de oreo de culones de la raza asturiana de los valles

  • Coto, Ana
  • Caballero, Beatriz
  • Sierra, V.
  • Vega-Naredo, I.
  • Tomás, C.
  • Hardeland, R.
  • Tolivia, D.
  • Ureña, F.
  • Rodríguez, M.J. (M.)
En este trabajo se han medido las actividades de tres de los principales enzimas antioxidantes: la superóxido dismutasa, la catalasa y glutatión reductasa, así como el daño oxidativo de lípidos y proteínas a lo largo del periodo de oreo, mediante medidas efectuadas cada seis horas en el Longissimus dorsi de animales pertenecientes a la raza de ganado vacuno Asturiana de los Valles. Al mismo tiempo, se relacionaron los resultados obtenidos con mediciones a las mismas horas de los valores de pH y temperatura de las canales almacenadas. Los resultados obtenidos mostraron que la actividad de la glutatión reductasa permanecía estable a lo largo de las 24 horas de almacenamiento. La superóxido dismutasa y la catalasa por el contrario, mostraron un incremento de actividad durante las primeras 12 horas inmediatas al sacrificio, mientras que el pH decrecía hasta valores de 6,0 y la temperatura de las canales llegaba hasta valores próximos a 15º C. Los cambios observados en los enzimas antioxidantes se correlacionaron perfectamente con los encontrados en daño de lípidos y proteínas. Un descenso en la actividad de los enzimas la superóxido dismutasa y la catalasa después de las primeras 12 horas de almacenamiento trajo consigo un incremento significativo a las 18 horas del daño en las proteínas. Sin embargo, el daño de lípidos no se vio alterado durante estas primeras 24 horas, por lo que, este proceso debe tener lugar en estadios más tardíos de maduración de las canales. Procedimientos futuros encaminados a mejorar la calidad de la carne y su terneza deberían tener en cuenta estos datos sobre destrucción oxidativa de macromoléculas ya que este trabajo muestra que los enzimas antioxidantes están involucrados en la evolución de las proteínas post-mortem.
Proyecto:


Red temática de alimentación animal

  • Argamentería, Alejandro
The Spanish Institute of Agriculture and Food Research has improved the creation of thematic networks during the period 2000-2003. They were essentially conceived as coordination mechanisms for research, development and innovation. In this context, the mentioned Institute impelled the Thematic Network of Feeding. It was defined as a established relation between many scientific Spanish societies (including the Asociación Interprofesional para el Desarrollo Agrario), the Ministry of Agriculture, Fisheries and Food, and the collectives of the nutritionists of the autonomicals research centres, the feed manufacturers and the agricultural cooperatives. Their general objective is to create and to keep an opened forum for discussion, information and research on animal nutrition and feeding. The specific objectives include decisions, proposals, needs, research co-ordinated projects, available information, divulgation, transference, relations with foreign centres and mobility of the researchers. To be able to make this objectives come true, the Thematic Network of Feeding have a leader and a representative of each one of theirs diverse societies and collectives (Promotive Corporations) into the named Executive Commission. This group meets periodically for making concrete activities. All the members of the Promotive Corporations will be invited to participate in the subsequent jobs and they can send their opinions, suggestions, councils, etc, to the leader at every moment. This participation will demand the organization of Thematic Groups, variable in the time according to the characteristics of the activity in course., El Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria viene impulsando desde hace tres años la creación de redes temáticas, concebidas esencialmente como mecanismos de coordinación de actividades de investigación, desarrollo e innovación. Dentro de este contexto, auspició la creación de la Red Temática de Alimentación Animal, como una conexión institucionalizada entre diversas entidades nacionales de carácter científico (incluida la Asociación Interprofesional para el Desarrollo Agrario), el Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación, el colectivo de investigadores en comunidades autónomas, el de fabricación de alimentos compuestos para animales y el de cooperativas agrarias. Su objetivo general es crear y mantener un foro participativo de discusión, información e investigación sobre Nutrición y Alimentación Animal. Para alcanzar los objetivos específicos (decisiones, propuestas, necesidades, proyectos coordinados, información disponible, divulgación, transferencia, proyección al exterior, contactos), la red tiene un líder y cada una de las organizaciones participantes (Entidades Promotoras) dispone de un representante en la que se denomina Comisión Ejecutiva. Esta se reúne periódicamente para emprender acciones concretas, abiertas a todos los miembros de cada Entidad Promotora, los cuales a su vez pueden enviar al líder opiniones, sugerencias, consejos, etc., en cualquier momento. Ello exigirá la constitución de Grupos Temáticos (trabajo en común según necesidades, variables en el tiempo).
Proyecto:


Enzimas antioxidantes en la maduración de carne de vacuno procedente de dos cabañas autóctonas asturianas

  • Caballero, Beatriz
  • Sierra, V.
  • Vega-Naredo, I.
  • Tomás, C.
  • Rodríguez, M.J. (M.)
  • Tolivia, D.
  • Hardeland, R.
  • Oliván, M.C. (María)
  • Coto, Ana
Antioxidant enzymes throughout ageing from two local cattle breeds In this study, meat from double-muscled (“culones”, mh/mh) and normal (+/+) young bulls of the breed Asturiana de los Valles (AV) as well as normal (+/+) animals from Asturiana de la Montaña (AM) was analysed during ageing at 4°C with regard to its oxidative status. Activities of the following main antioxidant enzymes were determined: Superoxide dismutase (SOD), Catalase (CAT) and Glutathione reductase (GR). In both breeds (AV and AM), lipid peroxidation (LPO) was also measured throughout the ageing period, because meat shelf life is mainly limited by lipids and proteins. All enzymes were apparently stable during meat ageing. While GR exhibited the lowest activity among antioxidant enzymes, SOD and CAT showed activity along the ageing period studied, with similar activity pattern seen in both double-muscled and normal animals, although, being advanced in the formers. In normal animals of both the AV and AM breeds, lipid peroxidation did not vary during ageing. However, double- muscled meat showed a significant increase after 7 days of maturation., En este trabajo se determinó el estado oxidativo de la carne procedente de terneros añojos de genotipo culón (mh/mh) y normal (+/+) de la raza Asturiana de los Valles (AV) así como terneros normales (+/+) de la raza Asturiana de la Montaña (AM) durante su periodo de maduración a 4ºC, mediante el estudio de la actividad de los principales enzimas antioxidantes: Superóxido dismutasa (SOD), Catalasa (CAT) y Glutatión reductasa (GR). Se midió también el nivel de peroxidación lipídica (LPO) a lo largo de la maduración a 4ºC de carne procedente de ambas razas (AV y AM) por ser los lípidos y las proteínas las biomoléculas que más limitan la vida media de la carne durante este periodo. Los resultados reflejaron una clara estabilidad de los enzimas durante el periodo de maduración de la carne, siendo el enzima GR el que mostró menor actividad, mientras que SOD y CAT presentaron actividad a lo largo de todo el período de maduración estudiado con un patrón de actividad que se repitió en la carne de terneros (mh/mh) y (+/+) de raza AV, siendo más adelantado en los primeros que en los segundos. La peroxidación lipídica no mostró variación alguna a lo largo de la maduración tanto en animales (+/+) de la raza AV como en animales (+/+) de la raza AM. Sin embargo, los animales (mh/mh) de la raza AV mostraron un incremento significativo del daño lipídico en el músculo tras 7 días de maduración.
Proyecto:


Diversidad filogenética como método de utilidad en programas de conservación de recursos genéticos ganaderos

  • Goyache, Félix
  • Carús, J.L. (J.)
  • Álvarez, Isabel
  • Gutiérrez, J.P. (Juan)
  • Fernández, Itziar
  • Royo, L.J. (Luis)
Phylogenetic diversity as a tool in conservation of animal genetic resources The aim of this note is to overview the characteristics of the Phylogenetic Diversity (PD) method in order to quantify genetic diversity in animal genetic resources conservation programs. The PD method performance has been compared with that of the Weitzman approach on a dataset consisting in 398 individuals belonging to 11 Spanish sheep breeds that were genotyped for a set of 14 microsatellites. Results from the PD and the Weitzman methods are similar. However, the PD method is less computing intensive thus allowing for its use at individual level. Moreover the PD does not need the assumption of ultrametricity of the distances. The use of the PD method in livestock conservation programs can be advanteageous with respect the Weitzman approach., El objetivo de esta nota es revisar las características de la metodología de cuantificación de la diversidad conocida como diversidad filogenética (PD), para evaluar su utilización en programas de conservación de recursos genéticos animales. El parámetro PD es uno de los más utilizados en estudios ecológicos pero no se ha utilizado en ganadería. Se ha comparado el rendimiento del método PD con el método filogenético de Weitzman y se ha aplicado a un conjunto de datos consistente en 398 individuos de 11 razas ovinas españolas genotipados para una batería de 14 marcadores microsatélite. Los resultados del método de Weitzman y el método PD tienden a ser similares en los extremos de la ordenación de las razas a efectos de su importancia en la conservación. Sin embargo, el método PD es más sencillo y rápido de calcular, permitiendo su uso rutinario a nivel individual y, además, no asume, al contrario del método de Weitzman, que las distancias deban ser ultramétricas. La utilización del parámetro PD en programas de conservación puede ser ventajosa respecto del método de Weitzman.
Proyecto:


Association between a common KCNJ11 polymorphism (rs5219) and new-onset posttransplant diabetes in patients treated with Tacrolimus

  • Coto, Eliecer
  • Torres, Armando
  • Díaz-Corte, Carmen
  • Díaz-Molina, Beatriz
  • Ortega, Francisco
  • Arias, Manuel
  • Díaz, J.M. (Juan)
  • Selgas, Rafael
  • López-Larrea, Carlos
  • Ruiz-Ortega, Marta
  • Ortiz, Alberto
  • González, Elena
  • Campistol, J.M. (J.)
  • Álvarez, Victoria
KCNJ11 polymorphisms have been linked to the risk of developing type 2 diabetes. Our aim was to define the contribution of KCNJ11 to new-onset diabetes after transplantation (NODAT) among patients treated with Tacrolimus (Tac). A total of 115 NODAT and 205 non-NODAT were genotyped for rs5219 (p.E23K). AA+AG genotypes were significantly associated with NODAT-risk (p=0.004; OR=2.10). The reported effect of this KCNJ11 polymorphism on insulin release by beta cells could explain this association, This work has been supported by the Instituto de Salud Carlos III-REDinREN (RETICS 0016), grant FIS-ETS-08/90008, the FEDER Funding Program from the European Union, and Sociedad Española de Cardiología (Beca Investigación Clínica).
Proyecto:


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