Dataset.

RNA-Seq data set of Pennycress seed maturation

Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/346411
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Alfonso Lozano, Miguel
  • Claver Lacasa, Ana
  • Luján Serrano, María Ángeles
  • López Sánchez, María Victoria
[EN] A single excel file containing 4 different sheets. Each sheet corresponds to the compared gene expression analysis between each of the different seed maturation stages with respect to the initial GREEN one. Each sheet contains the raw data, log2fold change, p-values, pdaj and FPKM values for each identified 20,016 genes in the pennycress genome. No specific software is needed to read the .xls files. [ES] Un único fichero Excel que contiene 4 hojas independientes. Cada hoja corresponde al análisis comparado de la expresión génica de cada uno de los estadios de maduración con respecto al estadio VERDE inicial. Cada hoja contiene los datos brutos de expresión, cambios en el Log2fold change, p-values, pdaj y valores FPKM para cada uno de los 20.016 genes identificados en nuestro análisis en el genoma de Pennycress. No se necesita ningún software específico para leer los archivos .xls. This dataset is covered by a Creative Commons Licence Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0)., [EN] This dataset contains the results obtained from a RNA-Seq analysis performed on five (5) different seed maturation stages of Pennycress (Thlaspi arvense), corresponding to GREEN, GREEN-YELLOW, YELLOW-GREEN, YELLOW and MATURE seed maturation stages. Gene comparisons were performed with respect to the initial GREEN stage. Data show the expression of 20,016 genes encoding proteins., [ES] Este conjunto de datos corresponde a un estudio de RNA-Seq llevado a cabo en cinco (5) estadios de maduración diferentes de Pennycress (Thalspi arvense), que corresponden al estadio VERDE, VERDE-AMARILLO; AMARILLO-VERDE; AMARILLO y MADURO. Los datos muestran la expresión de 20.016 genes que codifican proteína., Grant PDI2021-1265630-B100 funded by MCIN/AEI/, Peer reviewed
 
DOI: http://hdl.handle.net/10261/346411
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HANDLE: http://hdl.handle.net/10261/346411
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Ver en: http://hdl.handle.net/10261/346411
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Dataset. 2024

RNA-SEQ DATA SET OF PENNYCRESS SEED MATURATION

Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Alfonso Lozano, Miguel
  • Claver Lacasa, Ana
  • Luján Serrano, María Ángeles
  • López Sánchez, María Victoria
[EN] A single excel file containing 4 different sheets. Each sheet corresponds to the compared gene expression analysis between each of the different seed maturation stages with respect to the initial GREEN one. Each sheet contains the raw data, log2fold change, p-values, pdaj and FPKM values for each identified 20,016 genes in the pennycress genome. No specific software is needed to read the .xls files. [ES] Un único fichero Excel que contiene 4 hojas independientes. Cada hoja corresponde al análisis comparado de la expresión génica de cada uno de los estadios de maduración con respecto al estadio VERDE inicial. Cada hoja contiene los datos brutos de expresión, cambios en el Log2fold change, p-values, pdaj y valores FPKM para cada uno de los 20.016 genes identificados en nuestro análisis en el genoma de Pennycress. No se necesita ningún software específico para leer los archivos .xls. This dataset is covered by a Creative Commons Licence Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0)., [EN] This dataset contains the results obtained from a RNA-Seq analysis performed on five (5) different seed maturation stages of Pennycress (Thlaspi arvense), corresponding to GREEN, GREEN-YELLOW, YELLOW-GREEN, YELLOW and MATURE seed maturation stages. Gene comparisons were performed with respect to the initial GREEN stage. Data show the expression of 20,016 genes encoding proteins., [ES] Este conjunto de datos corresponde a un estudio de RNA-Seq llevado a cabo en cinco (5) estadios de maduración diferentes de Pennycress (Thalspi arvense), que corresponden al estadio VERDE, VERDE-AMARILLO; AMARILLO-VERDE; AMARILLO y MADURO. Los datos muestran la expresión de 20.016 genes que codifican proteína., Grant PDI2021-1265630-B100 funded by MCIN/AEI/, Peer reviewed




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