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Contribución de congreso (ConferenceOutput). 2017

La diversidad molecular de endosimbiontes bacterianos asociados con el género Xiphinema (Nematoda: Longidoridae) revela una elevada congruencia filogenética con su huésped

DIGITAL.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Palomares Rius, Juan E.
  • Archidona-Yuste, Antonio
  • Cantalapiedra-Navarrete, C.
  • Prieto, Pilar
  • Castillo, Pablo
Trabajo presentado en el XVIII Congreso de la Sociedad Española de Fitopatología (SEF), celebrado en Palencia del 20 al 23 de septiembre de 2016., Se han detectado endosimbiontes bacterianos en algunos grupos de nematodos
fitoparásitos y parecen tener un papel fundamental en la adaptación al medio y
supervivencia de sus especies huésped. En este trabajo se ha determinado la presencia y
la diversidad molecular de estos endosimbiontes dentro de los nematodos ectoparásitos
migratorios de la familia Longidoridae (viz Xiphinema, Longidorus y Paralongidorus).
Se han testado 124 poblaciones de nematodos (previamente identificados
morfológicamente y molecularmente) frente a la presencia de endosimbiontes
bacterianos usando el gen ribosómico 16S. Solo se detectaron endosimbiontes
bacterianos en especies de nematodos pertenecientes al género Xiphinema y
específicamente dentro del grupo Xiphinema americanum. En este estudio se ha
secuenciado el gen 16S de 57 endosimbiontes bacterianos. Uno de los grupos de
secuencias perteneció al género “Candidatus Xiphinematobacter” (19 secuencias
asociadas con 7 especies de nematodos, incluyendo 2 especies descritas y 3 especies de
endosimbiontes no descritos anteriormente). El segundo grupo de endosimbiontes (38
secuencias asociadas con 5 especies de nematodos y 5 especies de endosimbiontes no
descritos anteriormente) estuvo relacionado con la familia Burkholderiaceae que incluye
también endosimbiontes fúngicos y de plantas. El grupo de endosimbiontes
pertenecientes a la familia Burkholderiaceae son citados por primera vez en el Phylum
Nematoda. Nuestros estudios indican una elevada relación simbiótica entre las especies
de nematodos huéspedes y estos endosimbiontes. Estos resultados fueron corroborados
con una elevada congruencia filogenética entre nematodo huésped-endosimbionte en
una larga co-evolución entre ellos. Asimismo, también se estudiaron las variaciones en
el genoma entre dos endosimbiontes asociados con las especies de nematodos
transmisores de virus Xiphinema americanum y Xiphinema rivesi., Investigación financiada por P12-AGR-1486-CICE, ArimNET_ERANET-219262-INIA, y fondos FEDER (EU)., Peer Reviewed
Proyecto: EC/FP7/219262




Contribución de congreso (ConferenceOutput). 2017

El diagnóstico integrativo de nematodos longidoridos revela una extraordinaria diversidad y prevalencia en olivo en Andalucía

DIGITAL.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Archidona-Yuste, Antonio
  • Navas Cortés, Juan Antonio
  • Cantalapiedra-Navarrete, C.
  • Palomares Rius, Juan E.
  • Castillo, Pablo
Póster presentado en el XVIII Congreso de la Sociedad Española de Fitopatología (SEF), celebrado en Palencia del 20 al 23 de septiembre de 2016., Las infecciones de olivo por nematodos fitoparásitos se han asociado con reducciones
del crecimiento y vigor en varios países de la Cuenca Mediterránea. Los nematodos
ectoparásitos migratorios de la familia Longidoridae (Longidorus, Paralongidorus y
Xiphinema) comprenden especies polífagas, y algunas de ellas transmiten
específicamente virus vegetales (nepovirus) de importancia económica. Hasta hoy, a
nivel mundial, se han citado 9 especies de Longidorus y 16 especies de Xiphinema
asociadas con olivo. En este trabajo se han realizado prospecciones fitonematológicas
sistematizadas y extensas en olivo cultivado (O. europaea subsp. europaea) y silvestre
(O. europaea subsp. sylvestris) en un total de 453 puntos de muestreo (115 asociados a
olivo silvestre y 338 a olivo cultivado), ampliamente distribuidos en 211 localidades del
territorio andaluz. El diagnóstico integrativo (combinando estudios morfométricos y
moleculares) ha permitido identificar 13 especies del género Longidorus (6 de ellas
nuevas para la ciencia) y 32 especies del género Xiphinema, 10 especies pertenecientes
a X. americanum-group (2 de ellas nuevas para la ciencia) y 22 especies pertenecientes
a X. no-americanum-group, (8 de ellas nuevas para la ciencia). La prevalencia media fue
10 veces mayor en Xiphinema spp. que en Longidorus spp. (85,0% vs. 8,4%), siendo la
prevalencia de Longidorus spp. en olivo silvestre mayor que en olivo cultivado (16,0%
vs. 6,0%), sin embargo, no se apreciaron diferencias significativas en Xiphinema spp.
(93,9% vs. 81,7%). La distribución geográfica de Longidorus spp. sugiere un patrón
relacionado con factores edáficos y ecológicos, mientras que en Xiphinema spp.
estuvieron ampliamente distribuidas y diferencialmente asociadas con la subespecie de
olivo. Los análisis filogenéticos basados en ADN ribosómico (fragmentos D2-D3 del
gen 28S, 18S, región ITS) han demostrado una elevada diversidad críptica y han
confirmado la delimitación y discriminación de las diferentes especies encontradas.
Asimismo, la filogenia de los tres marcadores moleculares mantuvo la mayoría de los
linajes y grupos detectados en ambos géneros en estudios anteriores. En conclusión, la
extraordinaria prevalencia y diversidad de este grupo de nematodos en olivo en
Andalucía sugiere que el sur de la Península Ibérica constituye un centro evolutivo de
Longidorus spp. y Xiphinema spp., Investigación financiada por P12-AGR-1486-CICE, AGL2012-37521-MINECO, ArimNET_ERANET-219262-INIA, y fondos FEDER (EU)., Peer Reviewed
Proyecto: EC/FP7/219262




Contribución de congreso (ConferenceOutput). 2017

Diversidad de genomas mitocondriales en Xiphinema. Longidorus y Paralongidorus (Nematoda: Longidoridae)

DIGITAL.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Palomares Rius, Juan E.
  • Cantalapiedra-Navarrete, C.
  • Archidona-Yuste, Antonio
  • Blok, Vivian C.
  • Castillo, Pablo
Póster presentado en el XVIII Congreso de la Sociedad Española de Fitopatología (SEF), celebrado en Palencia del 20 al 23 de septiembre de 2016., Los nematodos de la familia Longidoridae (viz. Longidorus, Paralongidorus, y
Xiphinema) comprenden especies fitoparásitas polífagas que pueden afectar a un gran
número de plantas. El daño que causan a los diferentes huéspedes depende no sólo de su
parasitismo directo sobre células epidérmicas y corticales de la raíz, sino también por la
transmisión específica de virus vegetales (nepovirus). El genoma mitocondrial de
nematodos fitoparásitos proporciona información esencial sobre su estructura genómica,
relaciones filogenéticas e inferencias funcionales y evolutivas. Hasta la fecha, X.
americanum era el único genoma mitocondrial secuenciado de la familia Longidoridae.
En este estudio se ha secuenciado el genoma mitocondrial de 4 especies de nematodos
fitoparásitos pertenecientes a esta familia, incluyendo Xiphinema rivesi, Xiphinema
pachtaicum, Longidorus vineacola y Paralongidorus litoralis. Los cuatro genomas
tienen un tamaño estimado de 12.6, 12.5, 13.5 y 12.8 kb, respectivamente, siendo de los
más pequeños descritos en el Phylum Nematoda. Todos los genomas contienen 12 genes
codificantes de proteínas (viz. cox1-3, nad1-6, nad4L, atp6 and cob) y dos genes
ribosómicos (rrnL and rrnS), estando ausente el gen atp8. La distribución génica resultó
muy variable entre ellos, a excepción de X. rivesi y X. americanum, especies
estrechamente emparentadas. Se identificaron 22 tRNAs en L. vineacola, 21 tRNAs en
X. rivesi y P. litoralis (faltando mt-tRNAN), y 19 tRNAs en X. pachtaicum (faltando mttRNAN,
mt-tRNAA y mt-tRNAR). Las regiones codificantes fueron muy pequeñas y
estuvieron presentes en pocas posiciones dentro del genoma. Los análisis filogenéticos
mostraron dos clados dentro de Longidoridae, uno incluyendo Longidorus y
Paralongidorus y otro incluyendo especies de Xiphinema. Xiphinema americanum y X.
rivesi están claramente relacionados filogenéticamente, mientras que la posición de X.
pachtaicum no estuvo claramente definida. Estos nuevos genomas mitocondriales
pueden aportar nuevos marcadores para la identificación de especies, y futuros estudios
filogenéticos., Investigación financiada por P12-AGR-1486-CICE, ArimNET_ERANET-219262-INIA, y fondos FEDER (EU)., Peer Reviewed
Proyecto: EC/FP7/219262




Contribución de congreso (ConferenceOutput). 2014

Diagnóstico y distribución de nematodos longidóridos en olivo cultivado y silvestre en Andalucía

DIGITAL.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Archidona-Yuste, Antonio
  • Navas Cortés, Juan Antonio
  • Cantalapiedra-Navarrete, C.
  • Castillo, Pablo
Trabajo presentado en el XVII Congreso de la Sociedad Española de Fitopatología, celebrado en Lleida del 7 al 10 de octubre de 2014., Las infecciones de olivo por nematodos fitoparásitos se han asociado con reducciones del
crecimiento y vigor de la planta en varios países de la Cuenca Mediterránea . Sin embargo, no
existen estudios sistematizados sobre la importancia y ecología de nematodos fitoparásitos que
infectan/infestan olivar en Andalucía, así como sobre los factores climáticos, agronómicos o del
cultivo, que determinan su distribución e interacción con la Verticilosis .
En este trabajo se han realizado prospecciones fitonematológicas sistematizadas en 60 de las 69
zonas biológicas de las ocho provincias Andaluzas establecidas por la Red de Información y Alerta
Fitosanitaria del olivar de Andalucía, que delimita áreas de cultivo de olivar con características
homogéneas de clima, orografía, hidrología, paisaje, etc ., así como zonas de vegetación natural de
olivo silvestre. Se han identificado infestaciones por más de un centenar de especies de nematodos
fitoparásitos pertenecientes a diferentes grupos tróficos de los cuales, uno de los grupos con mayor
extensión y biodiversidad fue el de los ectoparásitos migratorios del grupo de longidóridos que incluye
los géneros
Longidorus
(10 especies) y
Xiphinema
(24 especies) . La integración de caracterizaciones
convencionales (morfológicas y morfométricas) junto con análisis moleculares y filogenéticos
basados en ADN ribosómico (fragmentos D2-D3 del gen 28S, 18S, región ITS), y con análisis de
datos multivariantes han demostrado una elevada diversidad críptica (especies morfológicamente
indistinguibles pero filogenéticamente distantes) en el complejo del grupo
Xiphinema americanum
que
comprende alrededor de 60 especies cosmopolitas y de difícil identificación. El diagnóstico preciso en
este grupo es particularmente importante por incluir especies de cuarentena (grupos EPPO A1 y A2) y
vectores de virus vegetales de importancia económica .
Este trabajo demuestra la importancia, distribución y diversidad de nematodos fitoparásitos en
olivo en Andalucía así como la necesidad de integración de diferentes abordajes para el diagnóstico
rápido y preciso de los mismos . La información generada permitirá determinar los mecanismos
potenciales de dispersión de estos agentes y los factores que facilitan y/o determinan sus ataques
en olivar, lo que facilitará el desarrollo y aplicación de estrategias eficientes para su manejo
integrado., Investigación financiada por AGL2012-37521-MINECO, ArimNET_ERANET-219262-INIA, P12-AGR 1486-CICE, y fondos FEDER (EU)., No
Proyecto: EC/FP7/219262




Contribución de congreso (ConferenceOutput). 2014

PESTOLIVE: an historical and ecological approach for understanding and managing soil-borne parasite communities on olive in the Mediterranean basin

DIGITAL.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Mateille, T.
  • Castillo, Pablo
  • Jiménez-Díaz, Rafael M.
  • Landa, Blanca B.
  • Montes Borrego, Miguel
  • Navas Cortés, Juan Antonio
  • Yaseen, T.
Trabajo presentado en la 5th OLIVEBIOTEQ Conference (International Conference for OliveTrees and Olive Products), celebrada en Ammam (Jordania) del 3 al 6 de noviemnre de 2014.-- Mateille, T. et al.., PESTOLIVE (Contribution of olive history for the management of soil-borne
parasites in the Mediterranean Basin) is a project funded by ARIMNet, an ERANET
action supported by the 7th European Framework Programme and by non-European
Mediterranean countries.
PESTOLIVE (www1.montpellier.inra.fr/CBGP/pestolive) aims at producing knowledge
and tools for a new and efficient management of plant-parasitic nematodes (PPN) and
plant-pathogenic fungi (PPF) in olive (Olea europaea L.) cropping systems and
nurseries, while reducing the use of pesticides. Because of the anthropic continuum
from Olea post-glacial refuges to oleasters (domestication) and then to olive-trees
(breeding and cropping), the fragmentation of the PPN and PPF communities and of
their natural enemies could explain the scattered diversity of the control techniques
(especially resistance rootstocks, biocontrol, cropping strategies) developed and applied
all around the Mediterranean Basin. The novelty of PESTOLIVE is based on i) the
analysis and the management of the parasite diversity (ecology of communities) instead
of controlling emblematic species (population approach) and ii) the involvement of
knowledge about the historical co-adaptation of soil-borne parasite and natural enemies
communities to olive-tree domestication (origins and past assemblages) and breeding
that follows the history of O. europaea around the Mediterranean Basin., ARIMNet is coordinated by Dr. F. Jacquet and M. Ollagnon (INRA, France) and PESTOLIVE is co-funded by ANR (France), GDAR (Turkey), INIA (Spain), IRESA (Tunisia), MENESF CRS (Morocco) and NAGREF (Greece)., No
Proyecto: EC/FP7/219262




Contribución de congreso (ConferenceOutput). 2017

Inhibition of early development stages of rusts and powdery mildew by fungal and plant metabolites

DIGITAL.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Barilli, Eleonora
  • Cimmino, Alessio
  • González-Bernal, María José
  • Masi, Marco
  • Rubiales, Diego
  • Evidente, Antonio
Trabajo presentado en el 15th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union (Plant health sistaining Mediterranean ecosystems), celebrado en Córdoba (España) del 20 al 23 de junio de 2017., Foliar diseases caused by biotrophic pathogens, such
as rusts and powdery mildews, are major limiting
factors in legume and cereal production worldwide.
Crop protection is largely based on chemical control,
although there is renewed interest in the discovery
of natural products as alternatives to synthetic fungicides., This research was supported by FP7-ARIMNet-MEDILEG
and AGL2014-52871 projects and Programme STAR (A.C.)
financially supported by UniNa and Compagnia di San
Paolo, Italia., Peer reviewed




Contribución de congreso (ConferenceOutput). 2017

The utility of mrDNA and rDNA for barcoding and phylogeny identification of plant-parasitic nematodes from Longidoridae (Nematoda, Enoplea)

DIGITAL.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
  • Palomares Rius, Juan E.
  • Cantalapiedra-Navarrete, C.
  • Archidona-Yuste, Antonio
  • Subbotin, Sergei A.
  • Castillo, Pablo
Trabajo presentado en el 15th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union (Plant health sistaining Mediterranean ecosystems), celebrado en Córdoba (España) del 20 al 23 de junio de 2017., Traditional identification of plant-parasitic nematode
species by morphology and morphometric methods
is difficult because of the high morphological variability
which can lead to considerable overlapping of
many characters and ambiguous nematode identification.
It is essential to use several approaches to give
accurate species identification (integrative taxonomy)., This research was financially supported by grants P12-AGR 1486 and AGR-136 from ‘Consejeria de Economia, Innvovacion y Ciencia’ from Junta de Andalucia, and Union Europea, Fondo Europeo de Desarrollo regional, ‘Una manera de hacer Europa’, grant 219262 ArimNET_ERANET FP7 2012-2015 Project PESTOLIVE ‘Contribution of olive history for the management of soilborne parasites in
the Mediterranean basin’ from Instituto Nacional de Investigacion y Tecnologia Agraria y Alimentaria (INIA), and Project AGL-2012-37521 from `Ministerio de Economía y Competitividad’ of Spain., Peer reviewed
Proyecto: EC/FP7/219262