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Dataset. 2019

CRIA SURVEYS: HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Barton, Eric D.
  • Castro, Carmen G.
  • Alonso Pérez, Fernando
  • Zúñiga, Diana
  • Rellán, Trinidad
  • Arbones, Belén
  • Castaño, Mónica
  • Gilcoto, Miguel
  • Torres, R.
  • Figueiras, F. G.
  • Pérez, Fiz F.
  • Ríos, Aida F.
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 197 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad, clorofila y materia orgánica disuelta y particulada, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, El proyecto CRIA tuvo como objetivos (1) determinar la trayectoria y naturaleza del flujo a través de la ría exterior, (2) examinar la configuración de la circulación de las dos capas y seguir la propagación de las aguas afloradas y hundidas a través de la ría, y (3) determinar la tasa de descarga y las velocidades verticales relacionadas en la ría, tanto en condiciones de afloramiento como de hundimiento. Las observaciones detalladas proporcionan una visión de alta resolución de los procesos de intercambio entre los océanos y las rías y revelan importantes asimetrías en las respuestas de afloramiento y de hundimiento. En septiembre de 2006 y junio de 2007, a bordo R/V Mytilus, se realizaron tomas de muestras hidrográficas en la Ría de Vigo acompañando un muestreo de alta frecuencia sobre la circulación. Tiradas con un SeaBird 9/11 CTD equipado con una roseta con botellas Niskin de 1.7 L, para capturar muestras de agua de tres a seis profundidades. Se tomaron muestras para la determinación de salinidad, clorofila, nutrientes, pH y alcalinidad. Las salinidades se determinaron en un salinómetro Guildline Autosal 8400. La precisión de las mediciones de CTD para temperatura y salinidad fueron de 0,004 ºC y 0,005, respectivamente. Para la determinación de oxígeno disuelto, las muestras se recogieron directamente en frascos de vidrio calibrados de 110 mL y, tras la fijación con Cl2Mn y NaOH/NaI, se mantuvieron en la oscuridad hasta su análisis en el laboratorio 24 horas más tarde. El oxígeno se determinó por titulación potenciométrica del punto final de Winkler utilizando un analizador Titrino 720 (Metrohm) con una precisión de 0,5 micromol/kg., Para la determinación de nutrientes, las muestras de agua se recogieron en botellas de polietileno de 50 ml y se mantuvieron frías (4ºC) hasta su análisis en el laboratorio utilizando procedimientos estándar de análisis de flujo segmentado. Las precisiones fueron 0,02 micromol/L para nitrito, 0,1 microM para nitrato, 0,05 micromol/L para amonio, 0,02 micromol/L para fosfato y 0,05 micromol/L para silicato. Las muestras de alcalinidad total (TA) y pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml y se analizaron en pocas horas en el laboratorio base. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). La precisión fue 0.003 unidades de pH. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg. Se determinaron las concentraciones de clorofila A en un fluorómetro TD700 de Turner Designs después de filtrar 100 ml de agua de mar a través de filtros GF/F de 25 mm [Welschmeyer, 1994]. La materia orgánica suspendida se recolectó bajo vacío en filtros precombustionados (450ºC, 4 horas) Whatman GF/F de 25 mm de diámetro y 0,7 micrómetros de tamaño nominal de poro (POC/PON, 0,5-1,5 L de agua de mar). Todos los filtros se secaron durante la noche y se congelaron (-20ºC) antes del análisis. Las mediciones de POC y PON se realizaron con un analizador Perkin Elmer 2400 CHN. Se utilizó un estándar de acetanilida diariamente. La precisión del método es de 0,3 micromol/L para el carbono y 0,1 micromol/L para el nitrógeno. La determinación de fósforo orgánico particulado (POP), se siguieron los mismos procedimientos de recolección y almacenamiento que para POC/PON, después de la filtración de 250 ml de agua de mar. Se determinó por digestión H2SO4/HClO4 a 220°C del material particulado recogido en los filtros GF/F de Whatman. El ácido fosfórico producido se analizó, tras la neutralización, mediante el procedimiento SFA para el fosfato. Los estándares de fosfato se aplicaron todos los días de análisis. La precisión para todo el análisis fue de 0.02 micromol/L, CSIC y Plan Nacional de I+D del Gobierno de España, Peer reviewed

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DOI: http://hdl.handle.net/10261/196478
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Dataset. 2019

ZOTRACOS SURVEYS: BASIC HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Álvarez-Salgado, Xosé Antón
  • Aranguren-Gassis, María
  • Arbones, Belén
  • Brea, S.
  • Cabanas, José Manuel
  • Castaño, Mónica
  • Cortijo, Julio
  • Espinoza-González, O.
  • Gago, Jesús
  • González, José
  • González, E.
  • Graña, R.
  • Martínez, L.
  • Nieto-Cid, Mar
  • Padín, X. A.
  • Pazos Ferreiro, Pilar
  • Pérez, Fiz F.
  • Pérez, P.
  • Piedracoba, Silvia
  • Redondo, Waldo
  • Rellán, Trinidad
  • Rodríguez-Vázquez, M.
  • Rosón, Gabriel
  • Salgueiro, R.
  • Serret, Pablo
  • Teira, Eva
  • Teixeira, I. G.
  • Varela, Ramiro
  • Villacieros-Robineau, Nicolás
  • Vieitez dos Santos, Vanesa
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 371 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad, clorofila y materia orgánica, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, La zona costera de transición del noroeste de la Península Ibérica fue objeto de muestreo en tres cruceros realizados del 4 al 2 de diciembre de 2004, del 7 al 14 de febrero y del 23 al 30 de octubre de 2005 a bordo del buque oceanográfico "Cornide de Saavedra". Se muestreo a lo largo de un transecto latitudinal centrado a 41.92°N, cerca de la desembocadura del río Miño y otro frente a la Ría de Vigo. Un total de 5 a 7 estaciones fueron ocupadas durante cada crucero. La salinidad y la temperatura se registraron con una sonda de profundidad de conductividad-temperatura SBE 9/11 conectada al muestreador de roseta con doce botellas de PVC Niskin de 10 L con muelles internos de acero inoxidable. Las mediciones de la conductividad se convirtieron en valores prácticos de la escala de salinidad con la ecuación de la UNESCO (1986). La precisión de las mediciones de CTD para temperatura y salinidad fueron de 0,004 DEG-C y 0,005, respectivamente. Las muestras para los análisis de oxígeno disuelto, pH, alcalinidad total, sales de nutrientes, carbono orgánico disuelto y particulado y nitrógeno fueron recogidas semanalmente con la roseta de 12 botellas Niskin. Para la determinación de nutrientes, las muestras de agua se recogieron en botellas de polietileno de 50 ml y se mantuvieron frías (4ºC) hasta su análisis en el laboratorio utilizando procedimientos estándar de análisis de flujo segmentado. Las precisiones fueron 0,02 micromol/kg para nitrito, 0,1 micromol/kg para nitrato, 0,05 microM para amonio, 0,02 micromol/kg para fosfato y 0,05 micromol/kg para silicato. El oxígeno se determinó por titulación potenciométrica de Winkler utilizando un analizador Titrino 720 con una precisión de ±0,5 micromol/kg. Las muestras de alcalinidad total (TA) y pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml y se analizaron en pocas horas en el laboratorio base. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). La precisión fue 0,003 unidades de pH. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg. La materia orgánica suspendida se recolectó bajo vacío en filtros precombustionados (450ºC, 4 horas) Whatman GF/F de 25 mm de diámetro y 0,7 micrómetros de tamaño nominal de poro (POC/PON, 0,5-1,5 L de agua de mar). Todos los filtros se secaron durante la noche y se congelaron (-20ºC) antes del análisis. Las mediciones de POC y PON se realizaron con un analizador Perkin Elmer 2400 CHN. Se utilizó un estándar de acetanilida diariamente. La precisión del método es de 0,3 micromol C/L y 0,1 micromol N/L, CSIC y Plan Nacional de I+D del Gobierno de España, 1 data csv ‘29CS20041004_hy1.csv’ file and 1 readme.txt file, No

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DOI: http://hdl.handle.net/10261/196504
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oai:digital.csic.es:10261/196697
Dataset. 2019

CAIBEX-I: BASIC HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Alonso Pérez, Fernando
  • Álvarez-Salgado, Xosé Antón
  • Arbones, Belén
  • Barton, Eric D.
  • Barreiro, Beatriz
  • Castaño, Mónica
  • Castro, Carmen G.
  • Teixeira, I. G.
  • Froján, M.
  • Graña, R.
  • Neumier, T.
  • Pérez, Fiz F.
  • Pazos Ferreiro, Pilar
  • Villacieros-Robineau, Nicolás
  • Romera-Castillo, Cristina
  • Velo, A.
  • Vieitez dos Santos, Vanesa
  • Villegas-Ríos, David
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 191 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad y clorofila, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, El proyecto CAIBEX es un estudio coordinado para comparar la dinámica y actividad biogeoquímica contrastada que se da entre la zona costera y el océano adyacente en la zona de estudio. Es un programa de observación y modelización multidisciplinar que abarca diferentes escalas espaciales y temporales, incluyendo un estudio del papel de los filamentos en el afloramiento estival del caladero de Cabo Silleiro, Galicia (CAIBEX I) y el afloramiento perenne del caladero de Cabo Guir, Marruecos (CAIBEX III) con especial referencia a sus repercusiones en el reclutamiento/dispersión de paralarvas de pulpo común y a las transformaciones biogeoquímicas experimentadas por el material biogénico producido en la zona costera. La campaña CAIBEX I, realizada a bordo del buque Sarmiento de Gamboa, está enfocada al estudio de las estructuras y procesos a mesoescala del sistema de Cabo Silleiro, y tiene como meta principal la definición de la estructura tri-dimensional física, biológica y biogeoquímica de un filamento de afloramiento y su evolución en el tiempo como función del forzamiento por el viento. Para alcanzar estos objetivos, el plan de campaña se planteó tres modos de operación: 1) un mapeado rápido al principio y al fin de la campaña para localizar el filamento y observar los cambios en el contexto general durante el estudio; 2) varios experimentos de deriva en el filamento para ver el desarrollo de una parcela de agua mientras se traslada de la costa al océano; 3) cortes repetidos a través del filamento para estudiar su desarrollo in situ. En cada estación se realizaron perfiles verticales de temperatura, salinidad y oxígeno disuelto con un SBE911plus CTD. Se realizaron tiradas con una roseta con botellas de 10 L de PVC Niskin para obtener muestras de agua para análisis oxígeno disuelto y nutrientes inorgánicos disueltos. El oxígeno disuelto se determinó por titulación potenciométrica de Winkler. El error estándar analítico estimado fue de 1 μmol/kg. Las muestras de nutrientes se determinaron mediante análisis de flujo segmentado con el autoanalizador Alliance Futura siguiendo a Grashoff et al. (1999) con algunas mejoras (Mouriño y Fraga 1985). Los límites de detección fueron 0,02 μmol/L para nitritos, 0,05 μmol/L para nitratos, amonio y silicato y 0,01 μmol/L para fosfatos. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). Las muestras de pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron directamente en cubetas ópticas cilíndricas de 100 mm de longitud en las que se realizan directamente las medidas. La precisión fue 0,003 unidades de pH. Las muestras de alcalinidad total (TA) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg, CSIC, 1 data csv ‘29AH200901706_hy1.csv’ file and 1 readme.txt file, Peer reviewed

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DOI: http://hdl.handle.net/10261/196697
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/196697
HANDLE: http://hdl.handle.net/10261/196697
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/196697
PMID: http://hdl.handle.net/10261/196697
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/196697
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Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/283374
Dataset. 2019

DATA FROM: GLOBTHERM, A GLOBAL DATABASE ON THERMAL TOLERANCES FOR AQUATIC AND TERRESTRIAL ORGANISMS

  • Bennett, Joanne M.
  • Calosi, Piero
  • Clusella-Trullas, Susana
  • Martínez, Brezo
  • Sunday, Jennifer
  • Algar, Adam C.
  • Araújo, Miguel B.
  • Hawkins, Bradford A.
  • Keith, Sally
  • Kühn, Ingolf
  • Rahbek, Carsten
  • Rodríguez, Laura
  • Singer, Alexander
  • Villalobos, Fabricio
  • Olalla-Tárraga, Miguel Ángel
  • Morales-Castilla, Ignacio
[Usage Notes] GlobTherm, a global database on thermal tolerances for aquatic and terrestrial organisms, Excel format This database includes thermal tolerance metrics for 2,133 species of multicellular algae, plants, fungi, and animals in 43 classes, 203 orders and 525 families from both aquatic, and terrestrial realms, extracted from published studies. Abbreviated citations are included in the 'REF_min' and 'REF_max' variable in the data file. For full citations, please see the attached workbook, "References_1_09_2017.xlsx". The data are available in both Excel and CSV formats in the Dryad Digital Repository (doi:10.5061/dryad.1cv08). Updates to the data and metadata will be curated through the iDiv data portal (https://idata.idiv.de/). For example, in the future we plan to include interspecific variation in the dataset, to provide multiple estimates of thermal tolerance limits for a given species where estimates determined using the best possible methods will be more highly ranked. GlobalTherm_upload_10_11_17.xlsx References_1_09_2017.xlsx GlobTherm, a global database on thermal tolerances for aquatic and terrestrial organisms, CSV format This database includes thermal tolerance metrics for 2,133 species of multicellular algae, plants, fungi, and animals in 43 classes, 203 orders and 525 families from both aquatic, and terrestrial realms, extracted from published studies. Abbreviated citations are included in the 'REF_min' and 'REF_max' variable in the data file. For full citations, please see the attached workbook, "References_1_09_2017.xlsx". The data are available in both Excel and CSV formats in the Dryad Digital Repository (doi:10.5061/dryad.1cv08). Updates to the data and metadata will be curated through the iDiv data portal (https://idata.idiv.de/). For example, in the future we plan to include interspecific variation in the dataset, to provide multiple estimates of thermal tolerance limits for a given species where estimates determined using the best possible methods will be more highly ranked. GlobalTherm_upload_02_11_17.csv References_1_09_2017.xlsx, How climate affects species distributions is a longstanding question receiving renewed interest owing to the need to predict the impacts of global warming on biodiversity. Is climate change forcing species to live near their critical thermal limits? Are these limits likely to change through natural selection? These and other important questions can be addressed with models relating geographical distributions of species with climate data, but inferences made with these models are highly contingent on non-climatic factors such as biotic interactions. Improved understanding of climate change effects on species will require extensive analysis of thermal physiological traits, but such data are scarce and scattered. To overcome current limitations, we created the GlobTherm database. The database contains experimentally derived species’ thermal tolerance data currently comprising over 2,000 species of terrestrial, freshwater, intertidal and marine multicellular algae, pl ants, fungi, and animals. The GlobTherm database will be maintained and curated by iDiv with the aim of expanding it, and enable further investigations on the effects of climate on the distribution of life on Earth., Peer reviewed

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Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/283539
Dataset. 2019

DATA FROM: HEAT TOLERANCE IS MORE VARIABLE THAN COLD TOLERANCE ACROSS SPECIES OF IBERIAN LIZARDS AFTER CONTROLLING FOR INTRASPECIFIC VARIATION

  • Herrando-Pérez, Salvador
  • Monasterio, Camila
  • Beukema, Wouter
  • Gomes, Verónica
  • Ferri-Yáñez, Francisco
  • Belliure, Josabel
  • Chown, Steven L.
  • Buckley, Lauren B.
  • Vieites, David R.
  • Araújo, Miguel B.
[Methods] Author contributions: Monasterio, Beukema and Gómes lead field (lizard sampling) and lab (estimation of thermal limits and measurement of body weights) work, and Monasterio and Araújo designed experiments. Herrando-Pérez conceived the idea of the two research manuscripts (Functional Ecology, Journal of Animal Ecology) and submitted the data to Dryad. Funding: MBA partly funded through CGL2011-26852 project of the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness. Field and experimental work funded by IC&DT 1/SAESCTN/ALENT-07-0224-FEDER-001755 project led by MBA. Acknowledgements: We thank the Biological Station of “El Ventorrillo” for hosting the field team and for providing the thermal experimental facilities essential for this research. We also thank Tim Leerschool, Filipe Serrano and Matthijs Hollanders for their support in the field. Collection permits: Samples, experiments and use of experimental animals supported for Portuguese populations by permits 360 to 362/2014/CAPT and 550 to 552/2014/CAPT (Instituto da Conservação da Natureza e das Florestas), and for Spanish populations by permits (autonomous communities in parenthesis hereafter) SGYB/EF/FJRH Re-9H/13 & SGYB/AF/DBP Re-79y131/14 (Andalucía), 2014-500201724/2014/02343 & INAGA/5000201/24/2013/04434 (Aragón), DGMEN/SEN/avp_13_025_aut & DGMEN/SEN/avp_14_020_aut (Castilla La Mancha), P/CYL/101/2013 & EP/CYL/106/2014 (Castilla y León), CN0023/14/ACA1587(14) (Extremadura), 2566/RX131316//clave031/2013 & 2241/RX123724//clave018/2014 (Galicia), and 10/033298.9/13 & 10/013907.9/14 (Madrid). [Usage Notes] Content of dataset: Critical Thermal Maxima (CTmax) and Critical Thermal Minima (CTmax) and body weights of 304 male individuals belonging to 59 populations and 15 species of Iberian lizards (Dryad doi: 10.5061/dryad.1553pc3). Body weight, CTmax and CTmin available for all populations except the Moncayo/Soria/Spain population of Podarcis muralis for which CTmin was not measured. Dataset set used in two research manuscripts: Intraspecific variation in lizard heat tolerance alters estimates of climate impact / Journal of Animal Ecology (doi: 10.1111/1365-2656.12914) and Heat tolerance is more variable than cold tolerance across species of Iberian lizards after controlling for intraspecific variation / Functional Ecology (in press). Versions of dataset: the first version of the dataset contained CTmax data alone (Journal of Animal Ecology), species names, population codes, locality names (with region, country, lat/long), the second version of the dataset (Functional Ecology) contains the latter information along with CTmin and body-weight data while the locality names and lat/long have been refined., The widespread observation that heat tolerance is less variable than cold tolerance (‘cold-tolerance asymmetry’) leads to the prediction that species exposed to temperatures near their thermal maxima should have reduced evolutionary potential for adapting to climate warming. However, the prediction is largely supported by species-level global studies based on single estimates of both physiological metrics per taxon. We ask if cold-tolerance asymmetry holds for Iberian lizards after accounting for intraspecific variation in critical thermal maxima (CTmax) and minima (CTmin). To do so, we quantified CTmax and CTmin for 58 populations of 15 Iberian lizard species (299 individuals). Then, we randomly selected one population from each study species (population sample = 15 CTmax and CTmin values), tested for variance homoscedasticity across species, and repeated the test for thousands of population samples as if we had undertaken the same study thousands of times, each time sampling one different population per species. The ratio of variances in CTmax to CTmin across species varied up to 16-fold depending on the populations chosen. Variance ratios show how much CTmax departs from the cross-species mean compared to CTmin, with a unitary ratio indicating equal variance of both thermal limits. Sampling one population per species was six times more likely to result in the observation of greater CTmax variance (‘heat-tolerance asymmetry’) than cold-tolerance asymmetry. The null hypothesis of equal variance was twice as likely for cases of cold-tolerance asymmetry than for the opposite scenario. Range-wide, population-level studies that quantify heat and cold tolerance of individual species are urgently needed to ascertain the global prevalence of cold-tolerance asymmetry. While broad latitudinal clines of cold tolerance have been strongly supported, heat tolerance might respond to smaller-scale climatic and habitat factors hence go unnoticed in global studies. Studies investigating physiological responses to climate change should incorporate the extent to which thermal traits are characteristic of individuals, populations and/or species., British Ecological Society, Award: 4496-5470. European Union, Award: IC&DT 1/SAESCTN/ALENT-07-0224-FEDER-001755. Spanish Ministry of Economy and Competitiveness, Award: CGL2011-26852., Peer reviewed


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