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Dataset. 2019

VITAMIN E SUPPLEMENTATION –BUT NOT INDUCED OXIDATIVE STRESS- INFLUENCES TELOMERE DYNAMICS DURING EARLY DEVELOPMENT

  • Pérez-Rodríguez, Lorenzo
  • Redondo, T.
  • Ruiz-Mata, Rocío
  • Camacho, Carlos
  • Moreno-Rueda, Gregorio
  • Potti, Jaime
Peer reviewed

DOI: http://hdl.handle.net/10261/178409
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Dataset. 2019

CANTARERO ET AL 2019 CAROTENOID-BASED COLORATION PLOSONE

  • Cantarero, Alejandro
  • Pérez-Rodríguez, Lorenzo
  • Romero-Haro, Ana A.
  • Chastel, Olivier
  • Alonso-Álvarez, Carlos
Dataset of the scientific article "Carotenoid-based coloration predicts both longevity and lifetime fecundity in male birds, but testosterone disrupts signal reliability"., Financial support was obtained from the projects PII1I09-0271-5037, PII1C09-0128-4724, SBPLY/17/180501/000468 from the JCCM (co-financed with European Regional Development Fund –ERDF) and CGL2009-10883-C02-02 and CGL2015-69338-C2-2-P from Ministerio de Ciencia e Innovación (MICIN, Spain). AC and LP-R were supported by a “Juan de la Cierva-formación” postdoctoral grant from Ministerio de Economía, Industria y Competitividad (MINECO, FJCI-2015-23536) and a SECTI postdoctoral contract from the University of Castilla-La Mancha (UCLM), respectively., Peer reviewed

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Dataset. 2019

RAIA ACOUSTIC DOPPLER PROFILER (ADP) CURRENTS NEAR CAPE SILLEIRO (NW IBERIA)

RAIA_ADP_CAPESILLEIRO_V1.0

  • Barton, Eric D.
  • Barreiro, Beatriz
  • Meunier, Thomas
  • Granda Grandoso, Francisco de la
  • Villacieros-Robineau, Nicolás
  • Alonso Pérez, Fernando
  • Redondo, W.
This item is made of 2 files, of which 1 is the dataset in matlab format and the other (Readme .txt) include a small description of the computed variables. Dataset contributed to the Projects CAIBEX and RAIA.-- Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0). The authors appreciate that users of these data: 1) Contact Des Barton (e.d.barton@iim.csic.es; barton.des@gmail.com ) to follow the uses of the data, and 2) Include the requested acknowledgment (cite using the DOI of this dataset) in any presentations or publications, From November 2008 to April 2010, an upward-looking Sontek 500 ADP (configured for 3 m cell size and 5 minute sampling interval) was moored on the seabed in 75 m water depth at 42.083°N and 8.933ºW (RAIA station) near Cape Silleiro (NW Iberia, Atlantic Ocean). Each of the 25 current-velocity vertical levels were averaged every 10 minutes, This work has been funded by the Spanish Ministry of Education project “CAIBEX Shelf–ocean exchanges in the Canaries–Iberian Large Marine Ecosystem” (CTM2007–66408–C02–01/MAR, CTM2007–30809–E/MAR, CTM2008–05305–E/MAR); RAIA: ‘Observatorio oceánico del margen Ibérico’ (INTERREG 2009/2011; 0313/RAIA/E) ; and RAIA.co: ’Observatorio marino del margen ibérico y del litoral’ (INTERREG 2011/2013; 052/RAIA.co/1E), Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/190115
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Dataset. 2019

RAIA CTD SURVEYS (42.1ºN) NEAR CAPE SILLEIRO (NW IBERIA)

RAIA_CTD_SURVEYS_CAPESILLEIRO_V1.0

  • Barton, Eric D.
  • Barreiro, Beatriz
  • Meunier, Thomas
  • Granda Grandoso, Francisco de la
  • Villacieros-Robineau, Nicolás
  • Alonso Pérez, Fernando
  • Zúñiga, Diana
  • Froján, M.
  • Castro, Carmen G.
  • Redondo, W.
This item is made of 2 files, of which 1 is the dataset in matlab format and the other (Readme .txt) include a small description of the computed variables. Dataset contributed to the Projects CAIBEX and RAIA.-- Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0). The STRAMIX team appreciates that users of these data: 1) Contact Des Barton (e.d.barton@iim.csic.es; barton.des@gmail.com ) or Carmen G. Castro (cgcastro@iim.csic.es) to follow the uses of the data, and 2) Include the requested acknowledgment (cite using the DOI of this dataset) in any presentations or publications, From January to November 2009, 4 hydrographic cruises were carried out along a 42.1°N across-shelf section, near Cape Silleiro (NW Iberia, Atlantic Ocean). These cruises sampled along seven equally spaced stations from the position of the coastal Silleiro buoy at 8.93 °W (75 m depth) to a station located at 9.44°W (~580 m depth, Figure 1). A CTD (Seabird 25) equipped with fluorescence, turbidity and transmittance sensors was used for these hydrographic cruises. The cruises started at the shallow station between 08:00 to 11:00, and ended at the deepest station between 12:00 to 15:00, This work has been funded by the Spanish Ministry of Education project “CAIBEX Shelf–ocean exchanges in the Canaries–Iberian Large Marine Ecosystem” (CTM2007–66408–C02–01/MAR, CTM2007–30809–E/MAR, CTM2008–05305–E/MAR); RAIA: ‘Observatorio oceánico del margen Ibérico’ (INTERREG 2009/2011; 0313/RAIA/E) ; and RAIA.co: ’Observatorio marino del margén ibérico y del litoral’ (INTERREG 2011/2013; 052/RAIA.co/1E), No

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/190123
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Dataset. 2019

AGE-RELATED PATTERNS OF YOLK ANDROGEN DEPOSITION IN SPOTLESS STARLINGS [DATASET]

  • Muriel, Jaime
  • Pérez-Rodríguez, Lorenzo
  • Gil, Diego
Female birds can influence offspring development by adjusting egg size or by a differential allocation of egg resources. Such maternal effects can be expected to be shaped by natural selection, given the costs connected to the allocation of maternal resources. Among egg components, yolk androgens play an important role in affecting offspring life-history traits. Despite their relevance for nestling development, factors accounting for the observed within- and between-clutch variation are still poorly known. By using a cross-sectional sampling approach, we tested the effect of female age, laying order and laying date on the deposition of yolk androstenedione (A4) and testosterone (T), since young and older females could maximize their fitness differently according to breeding conditions. We found a remarkable lack of differences in overall yolk androgen levels across different ages. However, comparing first-year with older females, our results showed that age did not influence yolk T levels at the beginning of the breeding season, whereas at the end first-year females transferred lower hormone levels than older females. Within clutches, both androgens increased across the laying sequence, suggesting that late nestlings benefit from an increased allocation that could compensate hatching asynchrony. However, when considering A4 we found that, whereas older females always increased A4 levels across the laying sequence, first-year females did not increase it at the end of the breeding season, thus increasing the likelihood of brood reduction when environmental conditions became hardest. These findings suggest that yolk A4 variation may be particularly important at the within-clutch scale, by providing females with a tool to modify nestling hierarchies., The project was funded by projects CGL2011-26318 to DG (Ministerio de Economía y Competitividad) and PGC2018-099596-B-I00 to LP-R (Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, co-financed by the European Regional Development Fund -ERDF). JM was supported by a postdoctoral contract from the University of Extremadura (Junta de Extremadura - IB16121) and a postdoctoral grant from the Juan de la Cierva Subprogram (FJCI-2017-34109), with the financial sponsorship of the MICINN. LP-R was supported by a postdoctoral contract for accessing the Spanish System of Science, Technology and Innovation (SECTI) from the University of Castilla-La Mancha., Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/193896
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Dataset. 2019

DYBAGA: WEEKLY HYDROGRAPHIC DATASET ON SW GALICIAN SHELF

  • Pérez, Fiz F.
  • Nieto-Cid, Mar
  • Álvarez-Salgado, Xosé Antón
  • Castro, Carmen G.
  • Rosón, Gabriel
  • Redondo, W.
  • Gilcoto, Miguel
  • Ríos, Aida F.
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 1421 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad, clorofila y materia orgánica, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, Durante un año, se estudió la variabilidad a frecuencia semanal de los fenómenos de afloramiento y hundimiento en la plataforma gallega frente a la Ría de Vigo y su impacto en las diferentes variables biogeoquímicas y del ciclo del carbono. Se evaluó la importancia relativa de los procesos físicos y biológicos en la variabilidad de la pCO2. Se determinaron las tasas netas de producción de especies de carbono en el ecosistema (DIC, POC, DOC) para evaluar la importancia relativa de la acumulación versus la exportación de fracciones orgánicas disueltas y partículas recién formadas. El trabajo de campo también desarrolla el estudio de las composiciones elementales y bioquímicas de (1) la materia orgánica disuelta en el agua de mar, (2) las partículas blandas y duras suspendidas en el agua y (3) los materiales biogénicos que han sido mineralizados en la columna de agua del sistema de afloramiento del noroeste ibérico. Cuatro estaciones fueron muestreadas semanalmente desde mayo de 2001 hasta abril de 2002 entre la plataforma de separación y el centro de la Ría de Vigo (45 m de profundidad). La salinidad y la temperatura se registraron con una sonda de profundidad de conductividad-temperatura SBE 9/11 conectada al muestreador de roseta con doce botellas de PVC Niskin de 10 L con muelles internos de acero inoxidable. Las mediciones de la conductividad se convirtieron en valores prácticos de la escala de salinidad con la ecuación de la UNESCO (1986). La precisión de las mediciones de CTD para temperatura y salinidad fueron de 0,004 DEG-C y 0,005, respectivamente. Las muestras para los análisis de oxígeno disuelto, pH, alcalinidad total, sales de nutrientes, carbono orgánico disuelto y particulado y nitrógeno fueron recogidas semanalmente con la roseta de 12 botellas Niskin. Para la determinación de nutrientes, las muestras de agua se recogieron en botellas de polietileno de 50 ml y se mantuvieron frías (4ºC) hasta su análisis en el laboratorio utilizando procedimientos estándar de análisis de flujo segmentado. Las precisiones fueron 0,02 microM para nitrito, 0,1 microM para nitrato, 0,05 microM para amonio, 0,02 microM para fosfato y 0,05 microM para silicato. El oxígeno se determinó por titulación potenciométrica de Winkler utilizando un analizador Titrino 720 con una precisión de 0,5 micromol/kg. Las muestras de alcalinidad total (TA) y pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml y se analizaron en pocas horas en el laboratorio base. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). La precisión fue 0,003 unidades de pH. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg, La materia orgánica suspendida se recolectó bajo vacío en filtros precombustionados (450ºC, 4 horas) Whatman GF/F de 25 mm de diámetro y 0,7 micrómetros de tamaño nominal de poro (POC/PON, 0,5-1,5 L de agua de mar). Todos los filtros se secaron durante la noche y se congelaron (-20ºC) antes del análisis. Las mediciones de POC y PON se realizaron con un analizador Perkin Elmer 2400 CHN. Se utilizó un estándar de acetanilida diariamente. La precisión del método es de 0,3 micromol C/L y 0,1 micromol N/L. La materia orgánica disuelta se recolectó en frascos de 500 ml limpiados con ácido y se filtraron a través de filtros precombustionados (450°C, 4 horas) Whatman GF/F de 47 mm de diámetro (tamaño nominal de poro, 0,7 mm) en un sistema de filtración de vidrio limpiado con ácido, a baja presión de flujo N2. Las alícuotas para el análisis de DOC/DON se recogieron en ampollas de vidrio precombustionadas de 10 mL (450 °C, 12 horas). Después de la acidificación con H3PO4 a pH<2, las ampollas fueron termoselladas y almacenadas en la oscuridad a 4°C hasta el análisis. DOC y DON se midieron simultáneamente con un detector de quimioluminiscencia de óxido nítrico Antek 7020 específico de nitrógeno, acoplado en serie con el analizador de gas infrarrojo específico de carbono de un analizador de carbono orgánico Shimadzu TOC-5000 (Alvarez-Salgado y Miller, 1998). La precisión es de 0,7 micromol C/L para el carbono y 0,2 micromol N/L para el nitrógeno, CSIC y Plan Nacional de I+D del Gobierno de España, Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/196460
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oai:digital.csic.es:10261/196476
Dataset. 2019

REMODA SURVEYS: HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Álvarez-Salgado, Xosé Antón
  • Álvarez, Marta
  • Brea, S.
  • Castro, Carmen G.
  • Gago, Jesús
  • Gilcoto, Miguel
  • Nieto-Cid, Mar
  • Piedracoba, Silvia
  • Rellán, Trinidad
  • Redondo, W.
  • Rosón, Gabriel
  • Souto, C.
  • Varela, Ramiro
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 203 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad, clorofila y materia orgánica disuelta y particulada, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, REMODA se centra en el estudio del origen y destino de la materia orgánica disuelta en la Ría de Vigo a escalas temporales corta (3–4 días) y estacional. Se combinan medidas de variables de estado relevantes (carbono y nitrógeno orgánico, carbohidratos, fluorescencia tanto de la materia orgánica disuelta como en suspensión) con tasas de producción/consumo, tanto microbiano como fotoquímico (oxigeno, fluorescencia). Estas se relacionan con las condiciones, meteorológicas, termohalinas e hidrodinámicas del medio. Se muestrearon tres estaciones en una sección transversal en el centro de la Ría de Vigo. La estación central con 45 m de profundidad, se ha realizado un amplió muestreo de variables de estado. La salinidad y la temperatura se registraron con una sonda de profundidad de conductividad-temperatura SBE 9/11 conectada al muestreador de roseta con doce botellas de PVC Niskin de 10 L con muelles internos de acero inoxidable. Las mediciones de la conductividad se convirtieron en valores prácticos de la escala de salinidad con la ecuación de la UNESCO (1986). La precisión de las mediciones de CTD para temperatura y salinidad fueron de 0,004 ºC y 0,005, respectivamente. Para la determinación de oxígeno disuelto, las muestras se recogieron directamente en frascos de vidrio calibrados de 110 mL y, tras la fijación con Cl2Mn y NaOH/NaI, se mantuvieron en la oscuridad hasta su análisis en el laboratorio 24 horas más tarde. El oxígeno se determinó por titulación potenciométrica del punto final de Winkler utilizando un analizador Titrino 720 (Metrohm) con una precisión de 0,5 micromol/kg., Para la determinación de nutrientes, las muestras de agua se recogieron en botellas de polietileno de 50 ml y se mantuvieron frías (4ºC) hasta su análisis en el laboratorio utilizando procedimientos estándar de análisis de flujo segmentado. Las precisiones fueron 0,02 microM para nitrito, 0,1 microM para nitrato, 0,05 microM para amonio, 0,02 microM para fosfato y 0,05 microM para silicato. Las muestras de alcalinidad total (TA) y pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml y se analizaron en pocas horas en el laboratorio base. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). La precisión fue 0.003 unidades de pH. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg. La materia orgánica suspendida se recolectó bajo vacío en filtros precombustionados (450ºC, 4 horas) Whatman GF/F de 25 mm de diámetro y 0,7 micrómetros de tamaño nominal de poro (POC/PON, 0,5-1,5 L de agua de mar). Todos los filtros se secaron durante la noche y se congelaron (-20ºC) antes del análisis. Las mediciones de POC y PON se realizaron con un analizador Perkin Elmer 2400 CHN. Se utilizó un estándar de acetanilida diariamente. La precisión del método es de 0,3 microM para el carbono y 0,1 microM para el nitrógeno. La determinación de fósforo orgánico particulado (POP), se siguieron los mismos procedimientos de recolección y almacenamiento que para POC/PON, después de la filtración de 250 ml de agua de mar. Se determinó por digestión H2SO4/HClO4 a 220°C del material particulado recogido en los filtros GF/F de Whatman. El ácido fosfórico producido se analizó, tras la neutralización, mediante el procedimiento SFA para el fosfato. Los estándares de fosfato se aplicaron todos los días de análisis. La precisión para todo el análisis fue de 0.02 microM., La materia orgánica disuelta se recolectó en frascos de 500 ml limpiados con ácido y se filtraron a través de filtros precombustionados (450°C, 4 horas) Whatman GF/F de 47 mm de diámetro (tamaño nominal de poro, 0,7 mm) en un sistema de filtración de vidrio limpiado con ácido, a baja presión de flujo N2. Las alícuotas para el análisis de DOC/DON se recogieron en ampollas de vidrio precombustionadas de 10 mL (450 °C, 12 horas). Después de la acidificación con H3PO4 a pH<2, las ampollas fueron termoselladas y almacenadas en la oscuridad a 4°C hasta el análisis. DOC y DON se midieron simultáneamente con un detector de quimioluminiscencia de óxido nítrico Antek 7020 específico de nitrógeno, acoplado en serie con el analizador de gas infrarrojo específico de carbono de un analizador de carbono orgánico Shimadzu TOC-5000 (Alvarez-Salgado y Miller, 1998). La precisión es de 0,7 microM para el carbono y 0,2 microM para el nitrógeno. Las muestras para la determinación de fosforo orgánico disuelto fueron recolectadas y filtradas como se indica para las muestras DOC/DON. El filtrado se recogió en contenedores de polietileno de 50 mL y se congeló a -20°C hasta su análisis. Se midió mediante el sistema SFA para fosfato, tras la oxidación con Na2S2O8/borax y la radiación UV (Armstrong et al., 1966). Sólo se analizan los ésteres orgánicos monofosfóricos, ya que los polifosfatos son resistentes a este procedimiento de oxidación. Calibraciones diarias con fosfato, fosfato de fenilo y adenosina 5'-monofosfato (AMP) en de agua de mar. Se analizaron las normas de AMP para calcular la recuperación de los ésteres monofosfóricos (alrededor del 80%). La precisión del método se estimó en 0,04 microM, CSIC y Plan Nacional de I+D del Gobierno de España, 1 data csv ‘29MY20020702_hy1.csv’ file and 1 readme.txt file, Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/196476
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oai:digital.csic.es:10261/196504
Dataset. 2019

ZOTRACOS SURVEYS: BASIC HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Álvarez-Salgado, Xosé Antón
  • Aranguren-Gassis, María
  • Arbones, Belén
  • Brea, S.
  • Cabanas, J. M.
  • Castaño, Mónica
  • Cortijo, J.
  • Espinoza-González, O.
  • Gago, Jesús
  • González, José
  • González, E.
  • Graña, R.
  • Martínez, L.
  • Nieto-Cid, Mar
  • Padín, X. A.
  • Pazos Ferreiro, Pilar
  • Pérez, Fiz F.
  • Pérez, P.
  • Piedracoba, Silvia
  • Redondo, W.
  • Rellán, Trinidad
  • Rodríguez-Vázquez, M.
  • Rosón, Gabriel
  • Salgueiro, R.
  • Serret, Pablo
  • Teira, Eva
  • Teixeira, I. G.
  • Varela, Ramiro
  • Villacieros-Robineau, Nicolás
  • Vieitez dos Santos, Vanesa
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 371 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad, clorofila y materia orgánica, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, La zona costera de transición del noroeste de la Península Ibérica fue objeto de muestreo en tres cruceros realizados del 4 al 2 de diciembre de 2004, del 7 al 14 de febrero y del 23 al 30 de octubre de 2005 a bordo del buque oceanográfico "Cornide de Saavedra". Se muestreo a lo largo de un transecto latitudinal centrado a 41.92°N, cerca de la desembocadura del río Miño y otro frente a la Ría de Vigo. Un total de 5 a 7 estaciones fueron ocupadas durante cada crucero. La salinidad y la temperatura se registraron con una sonda de profundidad de conductividad-temperatura SBE 9/11 conectada al muestreador de roseta con doce botellas de PVC Niskin de 10 L con muelles internos de acero inoxidable. Las mediciones de la conductividad se convirtieron en valores prácticos de la escala de salinidad con la ecuación de la UNESCO (1986). La precisión de las mediciones de CTD para temperatura y salinidad fueron de 0,004 DEG-C y 0,005, respectivamente. Las muestras para los análisis de oxígeno disuelto, pH, alcalinidad total, sales de nutrientes, carbono orgánico disuelto y particulado y nitrógeno fueron recogidas semanalmente con la roseta de 12 botellas Niskin. Para la determinación de nutrientes, las muestras de agua se recogieron en botellas de polietileno de 50 ml y se mantuvieron frías (4ºC) hasta su análisis en el laboratorio utilizando procedimientos estándar de análisis de flujo segmentado. Las precisiones fueron 0,02 micromol/kg para nitrito, 0,1 micromol/kg para nitrato, 0,05 microM para amonio, 0,02 micromol/kg para fosfato y 0,05 micromol/kg para silicato. El oxígeno se determinó por titulación potenciométrica de Winkler utilizando un analizador Titrino 720 con una precisión de ±0,5 micromol/kg. Las muestras de alcalinidad total (TA) y pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml y se analizaron en pocas horas en el laboratorio base. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). La precisión fue 0,003 unidades de pH. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg. La materia orgánica suspendida se recolectó bajo vacío en filtros precombustionados (450ºC, 4 horas) Whatman GF/F de 25 mm de diámetro y 0,7 micrómetros de tamaño nominal de poro (POC/PON, 0,5-1,5 L de agua de mar). Todos los filtros se secaron durante la noche y se congelaron (-20ºC) antes del análisis. Las mediciones de POC y PON se realizaron con un analizador Perkin Elmer 2400 CHN. Se utilizó un estándar de acetanilida diariamente. La precisión del método es de 0,3 micromol C/L y 0,1 micromol N/L, CSIC y Plan Nacional de I+D del Gobierno de España, 1 data csv ‘29CS20041004_hy1.csv’ file and 1 readme.txt file, Peer reviewed

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DOI: http://hdl.handle.net/10261/196504
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/196504
HANDLE: http://hdl.handle.net/10261/196504
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PMID: http://hdl.handle.net/10261/196504
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Ver en: http://hdl.handle.net/10261/196504
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