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Los datos aqui presentados comprenden la ocurrencia y abundancia relativa de las diatomeas bentónicas identificadas en sistemas acuáticos de la Serranía de Cuenca (centro de España) durante el verano de 2017. Los taxones se ordenan en la matriz alfabéticamente y se les asigna un código. Las muestras se caracterizan tambien por un código y por información sobre su cuenca de origen (rio Tajo o Júcar), sustrato (mineral o planta) y hábitat (ambientes lénticos o lóticos). Toda esta información contenida en varias página de un documento excel., The data presented in this document comprised the occurrence and relative abundance of benthic diatom taxa identified in Serranía de Cuenca (central Spain) waters during summer of 2017. Taxa are ordered alphabetically in columns and named with a code (see the "Taxa code" sheet) The sample code and information on catchments (Tajo or Júcar rivers), substrate (mineral or plant) and habitat (stream or stagnant water) are reported in the "Sample code" sheet