BUSCADOR RECOLECTA

Dades associades a l'article publicat: Lemaitre, G., Marti, R., Freixenet, J., Vilanova, J.C., Walker, P.M. i Meriaudeau, F. (2015). Computer-Aided Detection and diagnosis for prostate cancer based on mono and multi-parametric MRI: A review. Computers in Biology and Medicine, vol. 60, p. 8-31. Disponible a https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2015.02.009, Instruccions per obrir els fitxers: cal concatenar els fitxers per crear el fitxer original. Dps es pot descomprimir amb tar al linux i amb 7zip al windows. Amb Linux console: cat file1 file2 file3 ... > file.tar.gz, descomprimir: tar -xzf file.tar.gz. I amb windows console: type file1 file2 file3 ... > file.tar.gz, descomprimir amb 7zip, Dataset available at I2CVB http://i2cvb.github.io/, Multi-parametric magnetic resonance imaging (MRI) dataset for prostate cancer detection. The purpose of this dataset is to help at the development of computer-aided detection and diagnosis (CAD) system of prostate cancer (CaP)

Instruccions per obrir els fitxers: cal concatenar els fitxers per crear el fitxer original. Dps es pot descomprimir amb tar al linux i amb 7zip al windows. Amb Linux console: cat file1 file2 file3 ... > file.tar.gz, descomprimir: tar -xzf file.tar.gz. I amb windows console: type file1 file2 file3 ... > file.tar.gz, descomprimir amb 7zip, Dades associades amb el capítol 6 de la següent tesi doctoral: Lemaître, Guillaume. “Computer-Aided Diagnosis for Prostate Cancer using Multi-Parametric Magnetic Resonance Imaging”. Tesi. Universitat de Girona i Université de Bourgogne Franche-Comté, 2016, Development and investigation of a multiparametric magnetic resonance CAD system for prostate cancer (CaP) detection. Data used for the pipeline developed in https://github.com/I2Cvb/mp-mri-prostate, Desenvolupament i investigació d'un sistema CAD de ressonància magnètica multiparamètrica per a la detecció del càncer de pròstata (CaP). Dades utilitzades per al pipeline desenvolupat a https://github.com/I2Cvb/mp-mri-prostate

Instruccions per obrir els fitxers: cal concatenar els fitxers per crear el fitxer original. Dps es pot descomprimir amb tar al linux i amb 7zip al windows. Amb Linux console: cat file1 file2 file3 ... > file.tar.gz, descomprimir: tar -xzf file.tar.gz. I amb windows console: type file1 file2 file3 ... > file.tar.gz, descomprimir amb 7zip, Dynamic contrast-enhanced magnetic resonance imaging (DCE-MRI) of prostate cancer to facilitate its diagnosis. A 3mm slice fat-suppressed T2W fast spin-echo sequence (TR/TE/ETL: 3400 ms/85 ms/13) is used to acquire images in sagittal and oblique coronal planes, the latter planes being orientated perpendicular or parallel to the prostate PZ – rectal wall axis. Three-dimensional T2W fast spin-echo (TR/TE/ETL: 3600 ms}/143 ms/109, slice thickness: 1.25 mm) images are then acquired in an oblique axial plane.The nominal matrix and FoV of the 3D T2W fast spin-echo images are 320x256 and 280x240 mm2, respectively, thereby affording sub-millimetric pixel resolution within the imaging plane.\nDCE-MRI is performed using a fat suppressed 3D T$_1$ VIBE sequence (TR/TE/Flip angle: 3.25 ms/1.12 ms/10 degrees; Matrix: 256x192; FoV: 280x210 (with 75% rectangular FoV); slab of 16 partitions of 3.5 mm thickness; temporal resolution: 6 s/slab over approximately 5 min). A power injector (Medrad, Indianola, USA) is used to provide a bolus injection of Gd-DTPA (Dotarem, Guerbet, Roissy, France) at a dose of 0.2 ml Gd-DTPA/kg of body weight

Instruccions per obrir els fitxers: cal concatenar els fitxers per crear el fitxer original. Dps es pot descomprimir amb tar al linux i amb 7zip al windows. Amb Linux console: cat file1 file2 file3 ... > file.tar.gz, descomprimir: tar -xzf file.tar.gz. I amb windows console: type file1 file2 file3 ... > file.tar.gz, descomprimir amb 7zip, The different algorithms of the "imbalanced-learn" toolbox are evaluated on a set of common dataset, which are more or less balanced. These benchmark have been proposed in Ding, Zejin, "Diversified Ensemble Classifiers for H ighly Imbalanced Data Learning and their Application in Bioinformatics." Dissertation, Georgia State University, (2011)

Material complementari de l'article publicat: Poater, A. (2016). Moving from Classical Ru-NHC to Neutral or Charged Rh-NHC Based Catalysts in Olefin Metathesis. Molecules, vol. 21, núm. 2, p. 177. Disponible a https://doi.org/10.3390/molecules21020177, Coordinate data sets and absolute energy (in a.u.), 3D structure for DFT optimized complexes with selected distances (in Å), Conjunts de dades de coordenades i energia absoluta (a.u.), estructura 3D per a complexos optimitzats DFT amb distàncies seleccionades (en Å), A.P. thanks the Spanish MINECO for a project CTQ2014-59832-JIN, and European Commission for a Career Integration Grant (CIG09-GA-2011-293900)

Projecte: AVCRI 279 Requeriments tècnics: L’entorn és l’EXCEL de Microsoft. L'accés al codi no estarà disponible fins la fi de la data d'embargament. Si esteu interessats a accedir-hi, contacteu amb idea(at)fbg.ub.edu, Aquesta Base de Dades (Guia de Medicaments) recull informació per tal d’indicar quins medicaments són susceptibles d'ajustos de dosi per evitar la iatrogènia medicamentosa en pacients amb deteriorament de la funció renal. Aquesta informació s'ha consensuat entre farmacèutics i metges nefròlegs a partir de la informació disponible en diferents bases de dades nacionals i internacionals. Per agilitzar l'ús de la Guia s'ha consensuat categoritzar en nivell baix, moderat o alt el risc que suposa pel pacient l’ús d'aquests medicaments segons el seu filtrat glomerular. A més la Guia recull els ajustos de dosi a realitzar, les interaccions medicamentoses i la simptomatologia per sobre dosificació en pacients amb funció renal disminuïda. A partir d'aquesta Base de Dades, s'ha dissenyat una aplicació web que facilita al professional sanitari la presa de decisions per a l'ajust de dosis de medicaments en funció del filtrat glomerular del pacient.

Relació de cupons concedits a autors de la Universitat de Barcelona per publicar en accés obert en una revista de la Royal Society of Chemistry (RSC) segons els termes de la iniciativa Gold for Gold. Inclou en format CSV el títol, els autors, la referència bibliogràfica i el DOI

Dades primàries associades a un article enviat a la revista PeerJ i pendent d'avaluació (Abril 2016), Podeu consultar l'article a: http://hdl.handle.net/2445/101599, Dades experimentals de la recerca on s'ha provat de veure si l'administració d'una dieta hiperlipídics (dieta de cafeteria) a rates mascles durant 30 dies, modifica la distribució del fluxs de sang entre els diferents teixits. Això s'ha fet mitjançant l'administració de microesferes fluorescents. S'ha pogut comprobar que hi ha un augment de flux cap el teixit adipós marró, pulmons i cor i una disminució cap a la pell. Això confirma l'augmenten en els teixits que controlen l'energia disipada.

Podeu consultar l'informe a que corresponen les dades a: http://hdl.handle.net/2445/100167

Dades primàries associades a l'article publicat a PLoS Neglected Tropical Diseases, vol. 10, num. 10, p. e0005009 [http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0005009], P. vivax infection during pregnancy has been associated with poor outcomes such as anemia, low birth weight and congenital malaria, thus representing an important global health problem. However, no vaccine is currently available for its prevention. Vir genes were the first putative virulent factors associated with P. vivax infections, yet very few studies have examined their potential role as targets of immunity. We investigated the immunogenic properties of five VIR proteins and two long synthetic peptides containing conserved VIR sequences (PvLP1 and PvLP2) in the context of the PregVax cohort study including women from five malaria endemic countries: Brazil, Colombia, Guatemala, India and Papua New Guinea (PNG) at different timepoints during and after pregnancy. Antibody responses against all antigens were detected in all populations, with PNG women presenting the highest levels overall. P. vivax infection at sample collection time was positively associated with antibody levels against PvLP1 (fold-increase: 1.60 at recruitment -first antenatal visit-) and PvLP2 (fold-increase: 1.63 at delivery), and P. falciparum co-infection was found to increase those responses (for PvLP1 at recruitment, fold-increase: 2.25). Levels of IgG against two VIR proteins at delivery were associated with higher birth weight (27 g increase per duplicating antibody levels, p<0.5). Peripheral blood mononuclear cells from PNG uninfected pregnant women had significantly higher antigen-specific IFN-g TH1 responses (p=0.006) and secreted less pro-inflammatory cytokines TNF and IL-6 after PvLP2 stimulation than P. vivax-infected women (p<0.5). These data demonstrate that VIR antigens induce the natural acquisition of antibody and T cell memory responses that might be important in immunity to P. vivax during pregnancy in very diverse geographical settings.