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Dataset. 2019

THROUGHFALL AND STEMFLOW PARTICULATE MATTER FLUXES AND SIZE DISTRIBUTION

  • Cayuela, Carles
  • Levia, Delphis F.
  • Latron, Jérôme
  • Llorens, Pilar
Data used in the study correspond to two datasets.-- Last update has been done in February 2019., [Flux_data.xls] Fluxes of PM in rain, throughfall and stemflow for two tree species (Quercus pubescens Willd. and Pinus sylvestris L.) from June 2015 to June 2016. In this file, no available data is indicated as “NA”. Data structure: • Date: Date of the sample collection • Rain flux: Particulate matter flux in rain (in mg m-2). • Th_Oak_flux: Particulate matter flux in throughfall for Quercus pubescens Willd. (in mg m-2). • Th_Pine_flux: Particulate matter flux in throughfall for Pinus sylvestris L. (in mg m-2). • Sf_Oak_flux: Particulate matter flux in stemflow for Quercus pubescens Willd. (in mg m-2). • Sf_Pine_flux: Particulate matter flux in stemflow for Pinus sylvestris L. (in mg m-2). • Rainfall: Accumulated rainfall between sampling days (in mm). • Origin: Air trajectory coming from: East, West or South. Calculated through 5-day backward trajectories using the HYSPLIT model (Rolph et al., 2017; Stein et al., 2015)., [Filters_data.xlsx] Results from the examination of filters of rainfall, throughfall and stemflow for both species and for 7 events. Data comes from a Zeiss LSM 510 Meta-5 Live Duo confocal microscope and a post processing made with ImageJ. The confocal microscopy analyses have been conducted at the BioImaging Centre at the University of Delaware. Data structure: Area: Area of particles (μm2). Perim.: Perimeter, length of the outside boundary of the particle (μm). Major: Primary axis of the best fitting ellipse (μm). Minor: Secondary axis of the best fitting ellipse (μm). Angle: Angle between the primary axis and a line parallel to the X-axis of the image (º). Circ.: Circularity 4π·([Area])/〖[Perimeter]〗^2 with a value of 1.0 indicating a perfect circle. As the value approaches 0.0, it indicates an increasingly elongated shape. Feret: Feret diameter, the longest distance between any two points along the selection boundary, also known as maximum caliper (μm). FeretAngle: The angle (0 - -180 degrees) of the Feret’s diameter (º). MinFeret: The minimum caliper diameter (μm). AR: Aspect ratio, the aspect ratio of the particle’s fitted ellipse, i.e., ([Major Axis])/([Minor Axis]) Round: Roundness, 4·([Area])/(π · 〖[Major axis]〗^2 ) or the inverse of Aspect Ratio. Solidity: ([Area])/([Convex Area]) Date: Date of the sampling. Type: Corresponding water flux. Rainfall (Rf), throughfall pines (Th_Pine), throughfall oaks (Th_Oak), stemflow pines (Sf_Pine) and stemflow oaks (Sf_Oak)., Particulate matter fluxes in a Mediterranean mountain forest: inter-specific differences between throughfall and stemflow in oak and pine stands. This project analyses the redistribution of water and particulate matter (PM) below forested areas in the Vallcebre research catchments during rainfall events. Data to analyse PM fluxes and diameter and shape distribution of PM has been produced by: Carles Cayuela, Delphis F. Levia, Jérôme Latron and Pilar Llorens., This research was supported by the projects TransHyMed (CGL2016-75957-R AEI/FEDER, UE) and MASCC-DYNAMITE (PCIN-2017-061/AEI) funded by the ‘‘Agencia Estatal de Investigación”. C. Cayuela was the beneficiary of a pre-doctoral FPI grant (BES-2014-070609) and a pre-doctoral mobility grant (EEBB-I-16-11510)., No

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Dataset. 2018

VITAL RATES AND COMPETITION COEFICIENTS [DATASET]

VITAL RATES AND COMPETITION COEFICIENTS FOR CONTROL ENVIRONMENT AND ESTREME DROUGHT (TREATMENT)

  • Matías Resina, Luis
  • Godoy, Óscar
  • Gómez Aparicio, Lorena
  • Pérez-Ramos, Ignacio Manuel
Data from: An experimental extreme drought reduces the likelihood of species to coexist despite increasing intransitivity in competitive networks.- Matías L, Godoy O, Gómez‐Aparicio L, Pérez-Ramos I (2018) An experimental extreme drought reduces the likelihood of species to coexist despite increasing intransitivity in competitive networks. Journal of Ecology 106(3): 826-837. https://doi.org/10.1111/1365-2745.12962 .- Data available from the Dryad Digital Repository: https://doi.org/10.5061/dryad.5d1s9 (Matías, Godoy, Gómez-Aparicio, & Pérez-Ramos, 2018, Very little is known about how variation in environmental conditions alters the strength and the structure of competitive networks and what are the consequences of this for species coexistence. We performed a competition experiment with 10 annual plant species to parameterise a population model describing species’ dynamics according to their vital rates and pairwise competitive coefficients. Seeds from all species were sown under two different climatic scenarios: (1) right before the first major storm of the growing season and (2) after an imposed fall drought of 2 months simulating an extreme climatic event of intense aridity. Species’ demography and competitive responses were used to estimate pairwise stabilising niche differences and average fitness differences. In addition, we used tools from network theory to characterise the structure of multispecies competition from the determinants of species coexistence. Specifically, we evaluated changes in competitive dominance between species pairs, and the prevalence of intransitive competitive relationships for 120 triplets between these two climatic events. The experimental extreme event significantly reduced fitness differences between species pairs. Such an equalising mechanism promotes coexistence. However, niche differences were also reduced in such a way that the number of species pairs whose niche differences overcame their fitness differences was reduced from six to two. Contrary to our expectations, the extreme event did not increase the hierarchy of competitive dominance. Instead, and depending on the technique used, the prevalence of intransitivity remained marginally similar (17% to 22%) or significantly increased from 19.4% to 29.8%. This pattern was likely a consequence of the significant changes in competitive dominance between species pairs (26 changes out of 45; 58%). Although fitness differences were equalised and intransitive competition promoted, our model predicted a lower likelihood of coexistence under the extreme event for both species pairs and triplets, mainly because competitive interactions did not promote enough niche differences to balance the observed fitness asymmetries in our competitive networks. Synthesis. We empirically proved that an extreme climate results in communities with reduced niche and fitness differences in which species are less likely to coexist despite the increasing prevalence of intransitive competition., Was funded by a Juan de la Cierva grant (FPDI-2013-15867). O.G. acknowledges postdoctoral financial support provided by the Spanish Ministry for Education and Science (Juan de la Cierva, JCI-2012-12061), and by the European Union Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Sklodowska-Curie grant agreement No 661118-BioFUNC. Funding support to conduct the experiment was provided by the Spanish Ecological Terrestrial Society (AEET, Jóvenes Investigadores grant 2014/2). L.G.-A. acknowledges support from the MICINN project INTERCAPA (CGL-2014-56739-R) and European FEDER Funds. I.M.P.-R thanks the funding provided by the Ramón & Cajal Research Programme (RYC-2013-13937) and the Spanish MINECO project DECAFUN (CGL2015-70123-R)., Peer reviewed

DOI: http://hdl.handle.net/10261/183909
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Dataset. 2019

REMODA SURVEYS: HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Álvarez-Salgado, Xosé Antón
  • Álvarez, Marta
  • Brea, S.
  • Castro, Carmen G.
  • Gago, Jesús
  • Gilcoto, Miguel
  • Nieto-Cid, Mar
  • Piedracoba, Silvia
  • Rellán, Trinidad
  • Redondo, W.
  • Rosón, Gabriel
  • Souto, C.
  • Varela, Ramiro
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 203 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad, clorofila y materia orgánica disuelta y particulada, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, REMODA se centra en el estudio del origen y destino de la materia orgánica disuelta en la Ría de Vigo a escalas temporales corta (3–4 días) y estacional. Se combinan medidas de variables de estado relevantes (carbono y nitrógeno orgánico, carbohidratos, fluorescencia tanto de la materia orgánica disuelta como en suspensión) con tasas de producción/consumo, tanto microbiano como fotoquímico (oxigeno, fluorescencia). Estas se relacionan con las condiciones, meteorológicas, termohalinas e hidrodinámicas del medio. Se muestrearon tres estaciones en una sección transversal en el centro de la Ría de Vigo. La estación central con 45 m de profundidad, se ha realizado un amplió muestreo de variables de estado. La salinidad y la temperatura se registraron con una sonda de profundidad de conductividad-temperatura SBE 9/11 conectada al muestreador de roseta con doce botellas de PVC Niskin de 10 L con muelles internos de acero inoxidable. Las mediciones de la conductividad se convirtieron en valores prácticos de la escala de salinidad con la ecuación de la UNESCO (1986). La precisión de las mediciones de CTD para temperatura y salinidad fueron de 0,004 ºC y 0,005, respectivamente. Para la determinación de oxígeno disuelto, las muestras se recogieron directamente en frascos de vidrio calibrados de 110 mL y, tras la fijación con Cl2Mn y NaOH/NaI, se mantuvieron en la oscuridad hasta su análisis en el laboratorio 24 horas más tarde. El oxígeno se determinó por titulación potenciométrica del punto final de Winkler utilizando un analizador Titrino 720 (Metrohm) con una precisión de 0,5 micromol/kg., Para la determinación de nutrientes, las muestras de agua se recogieron en botellas de polietileno de 50 ml y se mantuvieron frías (4ºC) hasta su análisis en el laboratorio utilizando procedimientos estándar de análisis de flujo segmentado. Las precisiones fueron 0,02 microM para nitrito, 0,1 microM para nitrato, 0,05 microM para amonio, 0,02 microM para fosfato y 0,05 microM para silicato. Las muestras de alcalinidad total (TA) y pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml y se analizaron en pocas horas en el laboratorio base. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). La precisión fue 0.003 unidades de pH. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg. La materia orgánica suspendida se recolectó bajo vacío en filtros precombustionados (450ºC, 4 horas) Whatman GF/F de 25 mm de diámetro y 0,7 micrómetros de tamaño nominal de poro (POC/PON, 0,5-1,5 L de agua de mar). Todos los filtros se secaron durante la noche y se congelaron (-20ºC) antes del análisis. Las mediciones de POC y PON se realizaron con un analizador Perkin Elmer 2400 CHN. Se utilizó un estándar de acetanilida diariamente. La precisión del método es de 0,3 microM para el carbono y 0,1 microM para el nitrógeno. La determinación de fósforo orgánico particulado (POP), se siguieron los mismos procedimientos de recolección y almacenamiento que para POC/PON, después de la filtración de 250 ml de agua de mar. Se determinó por digestión H2SO4/HClO4 a 220°C del material particulado recogido en los filtros GF/F de Whatman. El ácido fosfórico producido se analizó, tras la neutralización, mediante el procedimiento SFA para el fosfato. Los estándares de fosfato se aplicaron todos los días de análisis. La precisión para todo el análisis fue de 0.02 microM., La materia orgánica disuelta se recolectó en frascos de 500 ml limpiados con ácido y se filtraron a través de filtros precombustionados (450°C, 4 horas) Whatman GF/F de 47 mm de diámetro (tamaño nominal de poro, 0,7 mm) en un sistema de filtración de vidrio limpiado con ácido, a baja presión de flujo N2. Las alícuotas para el análisis de DOC/DON se recogieron en ampollas de vidrio precombustionadas de 10 mL (450 °C, 12 horas). Después de la acidificación con H3PO4 a pH<2, las ampollas fueron termoselladas y almacenadas en la oscuridad a 4°C hasta el análisis. DOC y DON se midieron simultáneamente con un detector de quimioluminiscencia de óxido nítrico Antek 7020 específico de nitrógeno, acoplado en serie con el analizador de gas infrarrojo específico de carbono de un analizador de carbono orgánico Shimadzu TOC-5000 (Alvarez-Salgado y Miller, 1998). La precisión es de 0,7 microM para el carbono y 0,2 microM para el nitrógeno. Las muestras para la determinación de fosforo orgánico disuelto fueron recolectadas y filtradas como se indica para las muestras DOC/DON. El filtrado se recogió en contenedores de polietileno de 50 mL y se congeló a -20°C hasta su análisis. Se midió mediante el sistema SFA para fosfato, tras la oxidación con Na2S2O8/borax y la radiación UV (Armstrong et al., 1966). Sólo se analizan los ésteres orgánicos monofosfóricos, ya que los polifosfatos son resistentes a este procedimiento de oxidación. Calibraciones diarias con fosfato, fosfato de fenilo y adenosina 5'-monofosfato (AMP) en de agua de mar. Se analizaron las normas de AMP para calcular la recuperación de los ésteres monofosfóricos (alrededor del 80%). La precisión del método se estimó en 0,04 microM, CSIC y Plan Nacional de I+D del Gobierno de España, 1 data csv ‘29MY20020702_hy1.csv’ file and 1 readme.txt file, Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/196476
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Dataset. 2019

CRIA SURVEYS: HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Barton, Eric D.
  • Castro, Carmen G.
  • Alonso Pérez, Fernando
  • Zúñiga, Diana
  • Rellán, Trinidad
  • Arbones, Belén
  • Castaño, Mónica
  • Gilcoto, Miguel
  • Torres, R.
  • Figueiras, F. G.
  • Pérez, Fiz F.
  • Ríos, Aida F.
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 197 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad, clorofila y materia orgánica disuelta y particulada, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, El proyecto CRIA tuvo como objetivos (1) determinar la trayectoria y naturaleza del flujo a través de la ría exterior, (2) examinar la configuración de la circulación de las dos capas y seguir la propagación de las aguas afloradas y hundidas a través de la ría, y (3) determinar la tasa de descarga y las velocidades verticales relacionadas en la ría, tanto en condiciones de afloramiento como de hundimiento. Las observaciones detalladas proporcionan una visión de alta resolución de los procesos de intercambio entre los océanos y las rías y revelan importantes asimetrías en las respuestas de afloramiento y de hundimiento. En septiembre de 2006 y junio de 2007, a bordo R/V Mytilus, se realizaron tomas de muestras hidrográficas en la Ría de Vigo acompañando un muestreo de alta frecuencia sobre la circulación. Tiradas con un SeaBird 9/11 CTD equipado con una roseta con botellas Niskin de 1.7 L, para capturar muestras de agua de tres a seis profundidades. Se tomaron muestras para la determinación de salinidad, clorofila, nutrientes, pH y alcalinidad. Las salinidades se determinaron en un salinómetro Guildline Autosal 8400. La precisión de las mediciones de CTD para temperatura y salinidad fueron de 0,004 ºC y 0,005, respectivamente. Para la determinación de oxígeno disuelto, las muestras se recogieron directamente en frascos de vidrio calibrados de 110 mL y, tras la fijación con Cl2Mn y NaOH/NaI, se mantuvieron en la oscuridad hasta su análisis en el laboratorio 24 horas más tarde. El oxígeno se determinó por titulación potenciométrica del punto final de Winkler utilizando un analizador Titrino 720 (Metrohm) con una precisión de 0,5 micromol/kg., Para la determinación de nutrientes, las muestras de agua se recogieron en botellas de polietileno de 50 ml y se mantuvieron frías (4ºC) hasta su análisis en el laboratorio utilizando procedimientos estándar de análisis de flujo segmentado. Las precisiones fueron 0,02 micromol/L para nitrito, 0,1 microM para nitrato, 0,05 micromol/L para amonio, 0,02 micromol/L para fosfato y 0,05 micromol/L para silicato. Las muestras de alcalinidad total (TA) y pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml y se analizaron en pocas horas en el laboratorio base. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). La precisión fue 0.003 unidades de pH. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg. Se determinaron las concentraciones de clorofila A en un fluorómetro TD700 de Turner Designs después de filtrar 100 ml de agua de mar a través de filtros GF/F de 25 mm [Welschmeyer, 1994]. La materia orgánica suspendida se recolectó bajo vacío en filtros precombustionados (450ºC, 4 horas) Whatman GF/F de 25 mm de diámetro y 0,7 micrómetros de tamaño nominal de poro (POC/PON, 0,5-1,5 L de agua de mar). Todos los filtros se secaron durante la noche y se congelaron (-20ºC) antes del análisis. Las mediciones de POC y PON se realizaron con un analizador Perkin Elmer 2400 CHN. Se utilizó un estándar de acetanilida diariamente. La precisión del método es de 0,3 micromol/L para el carbono y 0,1 micromol/L para el nitrógeno. La determinación de fósforo orgánico particulado (POP), se siguieron los mismos procedimientos de recolección y almacenamiento que para POC/PON, después de la filtración de 250 ml de agua de mar. Se determinó por digestión H2SO4/HClO4 a 220°C del material particulado recogido en los filtros GF/F de Whatman. El ácido fosfórico producido se analizó, tras la neutralización, mediante el procedimiento SFA para el fosfato. Los estándares de fosfato se aplicaron todos los días de análisis. La precisión para todo el análisis fue de 0.02 micromol/L, CSIC y Plan Nacional de I+D del Gobierno de España, Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/196478
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/196478
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oai:digital.csic.es:10261/196504
Dataset. 2019

ZOTRACOS SURVEYS: BASIC HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Álvarez-Salgado, Xosé Antón
  • Aranguren-Gassis, María
  • Arbones, Belén
  • Brea, S.
  • Cabanas, J. M.
  • Castaño, Mónica
  • Cortijo, J.
  • Espinoza-González, O.
  • Gago, Jesús
  • González, José
  • González, E.
  • Graña, R.
  • Martínez, L.
  • Nieto-Cid, Mar
  • Padín, X. A.
  • Pazos Ferreiro, Pilar
  • Pérez, Fiz F.
  • Pérez, P.
  • Piedracoba, Silvia
  • Redondo, W.
  • Rellán, Trinidad
  • Rodríguez-Vázquez, M.
  • Rosón, Gabriel
  • Salgueiro, R.
  • Serret, Pablo
  • Teira, Eva
  • Teixeira, I. G.
  • Varela, Ramiro
  • Villacieros-Robineau, Nicolás
  • Vieitez dos Santos, Vanesa
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 371 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad, clorofila y materia orgánica, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, La zona costera de transición del noroeste de la Península Ibérica fue objeto de muestreo en tres cruceros realizados del 4 al 2 de diciembre de 2004, del 7 al 14 de febrero y del 23 al 30 de octubre de 2005 a bordo del buque oceanográfico "Cornide de Saavedra". Se muestreo a lo largo de un transecto latitudinal centrado a 41.92°N, cerca de la desembocadura del río Miño y otro frente a la Ría de Vigo. Un total de 5 a 7 estaciones fueron ocupadas durante cada crucero. La salinidad y la temperatura se registraron con una sonda de profundidad de conductividad-temperatura SBE 9/11 conectada al muestreador de roseta con doce botellas de PVC Niskin de 10 L con muelles internos de acero inoxidable. Las mediciones de la conductividad se convirtieron en valores prácticos de la escala de salinidad con la ecuación de la UNESCO (1986). La precisión de las mediciones de CTD para temperatura y salinidad fueron de 0,004 DEG-C y 0,005, respectivamente. Las muestras para los análisis de oxígeno disuelto, pH, alcalinidad total, sales de nutrientes, carbono orgánico disuelto y particulado y nitrógeno fueron recogidas semanalmente con la roseta de 12 botellas Niskin. Para la determinación de nutrientes, las muestras de agua se recogieron en botellas de polietileno de 50 ml y se mantuvieron frías (4ºC) hasta su análisis en el laboratorio utilizando procedimientos estándar de análisis de flujo segmentado. Las precisiones fueron 0,02 micromol/kg para nitrito, 0,1 micromol/kg para nitrato, 0,05 microM para amonio, 0,02 micromol/kg para fosfato y 0,05 micromol/kg para silicato. El oxígeno se determinó por titulación potenciométrica de Winkler utilizando un analizador Titrino 720 con una precisión de ±0,5 micromol/kg. Las muestras de alcalinidad total (TA) y pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml y se analizaron en pocas horas en el laboratorio base. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). La precisión fue 0,003 unidades de pH. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg. La materia orgánica suspendida se recolectó bajo vacío en filtros precombustionados (450ºC, 4 horas) Whatman GF/F de 25 mm de diámetro y 0,7 micrómetros de tamaño nominal de poro (POC/PON, 0,5-1,5 L de agua de mar). Todos los filtros se secaron durante la noche y se congelaron (-20ºC) antes del análisis. Las mediciones de POC y PON se realizaron con un analizador Perkin Elmer 2400 CHN. Se utilizó un estándar de acetanilida diariamente. La precisión del método es de 0,3 micromol C/L y 0,1 micromol N/L, CSIC y Plan Nacional de I+D del Gobierno de España, 1 data csv ‘29CS20041004_hy1.csv’ file and 1 readme.txt file, Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/196504
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/196504
HANDLE: http://hdl.handle.net/10261/196504
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/196504
PMID: http://hdl.handle.net/10261/196504
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
oai:digital.csic.es:10261/196504
Ver en: http://hdl.handle.net/10261/196504
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oai:digital.csic.es:10261/196504

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oai:digital.csic.es:10261/196697
Dataset. 2019

CAIBEX-I: BASIC HYDROGRAPHIC AND CHEMICAL DATA

  • Alonso Pérez, Fernando
  • Álvarez-Salgado, Xosé Antón
  • Arbones, Belén
  • Barton, Eric D.
  • Barreiro, Beatriz
  • Castaño, Mónica
  • Castro, Carmen G.
  • Teixeira, I. G.
  • Froján, M.
  • Graña, R.
  • Neumier, T.
  • Pérez, Fiz F.
  • Pazos Ferreiro, Pilar
  • Villacieros-Robineau, Nicolás
  • Romera-Castillo, Cristina
  • Velo, A.
  • Vieitez dos Santos, Vanesa
  • Villegas Ríos, David
Este dataset está compuesto por 2 archivos, de los cuales el primero es el conjunto de datos con 191 análisis de muestras de agua de temperatura, salinidad, oxígeno, nutrientes, pH, alcalinidad y clorofila, y el otro (Readme.txt) incluye una pequeña descripción de las variables calculadas, El proyecto CAIBEX es un estudio coordinado para comparar la dinámica y actividad biogeoquímica contrastada que se da entre la zona costera y el océano adyacente en la zona de estudio. Es un programa de observación y modelización multidisciplinar que abarca diferentes escalas espaciales y temporales, incluyendo un estudio del papel de los filamentos en el afloramiento estival del caladero de Cabo Silleiro, Galicia (CAIBEX I) y el afloramiento perenne del caladero de Cabo Guir, Marruecos (CAIBEX III) con especial referencia a sus repercusiones en el reclutamiento/dispersión de paralarvas de pulpo común y a las transformaciones biogeoquímicas experimentadas por el material biogénico producido en la zona costera. La campaña CAIBEX I, realizada a bordo del buque Sarmiento de Gamboa, está enfocada al estudio de las estructuras y procesos a mesoescala del sistema de Cabo Silleiro, y tiene como meta principal la definición de la estructura tri-dimensional física, biológica y biogeoquímica de un filamento de afloramiento y su evolución en el tiempo como función del forzamiento por el viento. Para alcanzar estos objetivos, el plan de campaña se planteó tres modos de operación: 1) un mapeado rápido al principio y al fin de la campaña para localizar el filamento y observar los cambios en el contexto general durante el estudio; 2) varios experimentos de deriva en el filamento para ver el desarrollo de una parcela de agua mientras se traslada de la costa al océano; 3) cortes repetidos a través del filamento para estudiar su desarrollo in situ. En cada estación se realizaron perfiles verticales de temperatura, salinidad y oxígeno disuelto con un SBE911plus CTD. Se realizaron tiradas con una roseta con botellas de 10 L de PVC Niskin para obtener muestras de agua para análisis oxígeno disuelto y nutrientes inorgánicos disueltos. El oxígeno disuelto se determinó por titulación potenciométrica de Winkler. El error estándar analítico estimado fue de 1 μmol/kg. Las muestras de nutrientes se determinaron mediante análisis de flujo segmentado con el autoanalizador Alliance Futura siguiendo a Grashoff et al. (1999) con algunas mejoras (Mouriño y Fraga 1985). Los límites de detección fueron 0,02 μmol/L para nitritos, 0,05 μmol/L para nitratos, amonio y silicato y 0,01 μmol/L para fosfatos. El pH del agua de mar se midió espectrofotométricamente siguiendo a Clayton y Byrne (1993) aplicándose una adición de 0,0047 (DelValls & Dickson, 1998). Las muestras de pH (escala de concentración total de hidrógeno, 25°C) se recogieron directamente en cubetas ópticas cilíndricas de 100 mm de longitud en las que se realizan directamente las medidas. La precisión fue 0,003 unidades de pH. Las muestras de alcalinidad total (TA) se recogieron en frascos de vidrio de 500 ml. El TA se determinó por titulación a pH 4,4 con HCl, según el método potenciométrico de Pérez y Fraga (1987) con una precisión de ±2 micromol/kg, CSIC, 1 data csv ‘29AH200901706_hy1.csv’ file and 1 readme.txt file, Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/196697
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oai:diposit.ub.edu:2445/128304
Dataset. 2019

CARDIAC AND MITOCHONDRIAL FUNCTION IN HIV-UNINFECTED FETUSES EXPOSED TO ANTIRETROVIRAL TREATMENT (CODE AND RAW DATA)

  • García-Otero, Laura
  • López, Marta
  • Guitart Mampel, Mariona
  • Morén Núñez, Constanza
  • Goncé Mellgren, Anna
  • Esteve, Carol
  • Salazar, Laura
  • Gómez, Olga
  • Martínez Crespo, Josep M. (Josep Maria)
  • Torres, Berta
  • César, Sergi
  • Garrabou Tornos, Glòria
  • Crispi Brillas, Fàtima
  • Gratacós Solsona, Eduard
Dades associades a l'article: Laura García-Otero, Marta López, Mariona Guitart-Mampel, Constanza Morén, Anna Goncé, Carol Esteve, Laura Salazar, Olga Gómez, Josep María Martínez, Berta Torres, Sergi César, Glòria Garrabou, Fàtima Crispi, Eduard Gratacós. (2019): Cardiac and mitochondrial function in HIV-uninfected fetuses exposed to antiretroviral treatment., Article publicat a la revista PLOS ONE, http://doi.org/10.1371/journal.pone.0213279 i al Dipòsit Digital de la UB http://hdl.handle.net/2445/148934, Mitochondrial toxicity related to intrauterine exposure to maternal HIV and combined antiretroviral treatment (cART) may have an impact on the heart of the uninfected offspring. The objective of the study was to evaluate fetal cardiovascular and mitochondrial biomarkers in HIV pregnancies.

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/2445/128304
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oai:digital.csic.es:10261/283803
Dataset. 2019

DATA FROM: DATA GAPS AND OPPORTUNITIES FOR COMPARATIVE AND CONSERVATION BIOLOGY

  • Conde, Dalia A.
  • Staerk, J.
  • Colchero, F.
  • da Silva, R.
  • Schöley, J.
  • Baden, H. Maria
  • Jouvet, L.
  • Fa, John E.
  • Syed, H.
  • Jongejans, E.
  • Meiri, S.
  • Gaillard, J.M.
  • Chamberlain, S.
  • Wilcken, J.
  • Jones, O. R.
  • Dahlgren, J. P.
  • Steiner, U. K.
  • Bland, L. M.
  • Gomez-Mestre, Iván
  • Lebreton, J.D.
  • Vargas, J. G.
  • Flesness, N.
  • Canudas-Romo, V.
  • Salguero-Gómez, R.
  • Byers, O.
  • Berg, T.B.
  • Scheuerlein, A.
  • Devillard, S.
  • Schigel, Dmitry S.
  • Ryder, O.A.
  • Possingham, Hugh P.
  • Baudisch, A.
  • Vaupel, J. W.
[Usage Notes] Data This folder contains 1.) the metadatabase of 22 data sources with 115,356 standardised demographic records for 14,529 taxonomically standardised species of 10 standardised demographic variables that were used in the article, 2.) the Demographic species knowledge index (DSKI), which indicates the amount of knowledge on mortality and fertility for a total of 32,144 species, which was calculated based on the amount of information present in the “DemographicDatabase.csv” used in the article. Additionally it includes the IUCN Red List Status and if the species is present in a zoo or aquarium in ZIMS, and the species taxonomic id for Catalog of Life and GBIF. MetaData The folder contains detailed documentation of the content of the data files in the folder “Data”: 1.) the documentation of column names, 2.) the references of the 22 demographic source databases, 3.) the original demographic variable names provided in the 22 source databases before demographic standardisation, their definition, and their demographic variable name after standardisation., Biodiversity loss is a major challenge. Over the past century, the average rate of vertebrate extinction has been about 100-fold higher than the estimated background rate and population declines continue to increase globally. Birth and death rates determine the pace of population increase or decline, thus driving the expansion or extinction of a species. Design of species conservation policies hence depends on demographic data (e.g., for extinction risk assessments or estimation of harvesting quotas). However, an overview of the accessible data, even for better known taxa, is lacking. Here, we present the Demographic Species Knowledge Index, which classifies the available information for 32,144 (97%) of extant described mammals, birds, reptiles, and amphibians. We show that only 1.3% of the tetrapod species have comprehensive information on birth and death rates. We found no demographic measures, not even crude ones such as maximum life span or typical litter/clutch size, for 65% of threatened tetrapods. More field studies are needed; however, some progress can be made by digitalizing existing knowledge, by imputing data from related species with similar life histories, and by using information from captive populations. We show that data from zoos and aquariums in the Species360 network can significantly improve knowledge for an almost eightfold gain. Assessing the landscape of limited demographic knowledge is essential to prioritize ways to fill data gaps. Such information is urgently needed to implement management strategies to conserve at-risk taxa and to discover new unifying concepts and evolutionary relationships across thousands of tetrapod species., Peer reviewed

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/10261/283803, http://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061/dryad.nq02fm3
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oai:diposit.ub.edu:2445/130597
Dataset. 2019

SCHOOL STAFF MEMBERS KNOWLEDGE OF VICTIMIZATION, DETECTION AND REPORTING

  • Greco, Ana Martina
  • Guilera Ferré, Georgina
  • Pereda Beltran, Noemí
Full protocol can be found in Spanish in the following link: http://hdl.handle.net/2445/117927 Or in Catalan, here: http://hdl.handle.net/2445/117926, Raw data from the study “School staff members knowledge of victimization, detection and reporting”. The study is centered in analyzing the level of knowledge of school staff members of Barcelona city of victimization, its detection and its reporting. Knowledge in this areas is measured through thirty statements to classify as true or false. The statements are coded as follows: F1 to F10: Statements about victimization F11 to F20: Statements about detection F21 to F30: Statements about reporting Correctly classified statements are coded with “1” and wrongly classified or unknown statements were coded as “0”. The data also includes variables of interest, such as self-perceived efficacy to detect sign in minors (“Scm”), self-perceived efficacy to detect signs in families (“Scf”), if the participant ever had a suspicions that a child under their care might be being victimized (“Detec”) and if the participant ever reported a potential victimization case outside the school (“Repor”). All these variables are coded as “1” if they were answered positively and “0” if they were answered negatively. The dataset also includes demographic variables, coded as follows: Sex (“Sex”): “0” mean “female” and “1” mean “male”. Role in school (“Role”): The first category (“0”) referred school staff who spent four hours or more in charge of the same group of children or adolescents, mainly kindergarten and elementary school teachers. The second category (“1”) included school staff members who spent less than four hours per day with the same group of students, like teachers of specific courses such as art, music, physical education, lunchtime or playground monitors. The last category (“2”) comprised staff such as head teachers, special education teachers or school psychologists who were not in charge of groups of children or adolescents but encountered them individually. School level in which the participant was working (“Level”): First category (“0”) included staff working in kindergarten or elementary school, second category (“1”) grouped staff working in middle or high school and the third category (“2”) referred to staff working in both levels. Results showed lower levels of knowledge in the reporting sections and significant relationship with detection and reporting experiences.

Proyecto: //
DOI: http://hdl.handle.net/2445/130597
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oai:digital.csic.es:10261/177233
Dataset. 2009

DATASET OF THE INFLUENCE OF COVER CROPS AND TILLAGE ON WATER AND SEDIMENT YIELD, AND ON NUTRIENT, AND ORGANIC MATTER LOSSES IN AN OLIVE ORCHARD ON A SANDY LOAM SOIL

  • Gómez Calero, José Alfonso
  • Guzmán, Gema
  • Giráldez, Juan Vicente
  • Fereres Castiel, Elías
This is an dataset accompaning the paper "The influence of cover crops and tillage on water and sediment yield, and on nutrient, and organic matter losses in an olive orchard on a sandy loam soil". Soil & Tillage Research 106 (1): 137-144. It contains three files with: a) The plot layout. b) The bimonthly runoff, sediment and nutrient losses in runoff and sediment. c) The soil moisture data, The support of the ProTerra project, funded by Syngenta Ltd, is gratefully acknowledged. The contribution of the Junta de Andalucía research project AGR2349 is also acknowledged., Peer reviewed

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